如何看待真核生物表达的复杂性和生
是认为人的基因数远远没有精确计算出来,有人认为实际上人的基因数应当在2。7~15。3万之间。但是,由于这个工作正在进行中,要到2003年才会有结果,所以目前似乎没有太大的说服力。
于是相当多的科学家认为应当从蛋白质来解释生命的复杂性,因为基因只是蛋白质的蓝图,基因与蛋白质的关系远非一对一,而是一对二、一对三甚至更多,少量的基因却可以设计出繁多而复杂的蛋白质,如,从消化食物到抵御疾病的蛋白质,所以生命现象才会复杂而精妙。
转录子的作用
转录子是开启和闭合目标基因的DNA结合蛋白,它忠实地转录基因的遗传信息,并且细胞只有在转录子翻译的遗传信息基础上才能生产各种各样的蛋白...全部
是认为人的基因数远远没有精确计算出来,有人认为实际上人的基因数应当在2。7~15。3万之间。但是,由于这个工作正在进行中,要到2003年才会有结果,所以目前似乎没有太大的说服力。
于是相当多的科学家认为应当从蛋白质来解释生命的复杂性,因为基因只是蛋白质的蓝图,基因与蛋白质的关系远非一对一,而是一对二、一对三甚至更多,少量的基因却可以设计出繁多而复杂的蛋白质,如,从消化食物到抵御疾病的蛋白质,所以生命现象才会复杂而精妙。
转录子的作用
转录子是开启和闭合目标基因的DNA结合蛋白,它忠实地转录基因的遗传信息,并且细胞只有在转录子翻译的遗传信息基础上才能生产各种各样的蛋白质,以维持生命现象和生理功能。
就所有的转录子而言,它们的数目在酵母、线虫、果蝇和人中是依次递增的。正由于如此,这些生物体内细胞的多样性也依次在增加。这意味着,维持多种多样的具有明显差异的细胞类型需要越来越多的分子开关。所以有人建议,应根据一种生物的基因组所能达到的RNA转录组(transcriptome)的数量和状态来判断生物的复杂性。
但是,如何测定RNA的转录组数量显然比较困难。
后来又有研究人员提出用转录子和它们调控的基因来解释生物和复杂性。比如,想要测试一种生态系统的复杂性,生态学家不仅要考虑物种的数量,而且要计算在这些物种当中相互反应的类型和数量。
比如,在一种食物网络(链)中相
互反应的复杂性可以用某种公式来计算。想要知道一种生态系统中营养传递的状况,就要由考虑到实际上的营养环节是由各种可能的因素来制约的,比如由物种数量N来相除。
基因网络与蛋白质组
有的研究人员认为,生命现象的复杂性实际上是由基因网络的调节作用来体现的,就像如今的计算机网络一样,各个节点是相互联系的,但它们的关系又是平等的、交互的。细菌和真核细胞的基因调节网络就是这样。
比如,大肠杆菌的基因转录调控分析揭示,平均每个转录子调控三个基因,而且每个基因还同时受控于两个转录子。而真核细胞的基因调控联系肯定比细菌多得多,只不过迄今还无法测定这种巨大的差异性和复杂性。
如同全球生态系统的统一性和复杂性一样,基因调控网络也有许多相互有关的"节点",包括下面一些环节:一个遗传网络的所有相关基因的数量,基因相互反应的数量,真正的相互反应的基因片断,影响特殊基因的一般基因数量,特殊基因影响一般基因的数量,与一种特殊基因发生直接反应的基因数量,每个基因发生基因反应的平均数量,基因中环节(节点)分布的偶数,两个随机选择的基因之间联系的步骤数量等。
但是,无论基因网络的调控多么复杂,最后都得体现到基因通过RNA(核糖核酸)转录所编码产生的蛋白质上面来。一种生物的蛋白质组(proteome)是该种生物所能产生的所有蛋白质,它们都是由RNA从基因那里转录、剪辑信
息后选择性拼接和修饰产生。
而RNA转录或RNA剪辑的选择性拼接和转录后的修饰能够产生比基因编码数目多得多的蛋白质,从而成为该种生物巨大的蛋白质组。
比如,从理论上讲,果蝇的一种叫做para的单基因(para是为纳离子通道编码的基因)通过RNA选择性拼接和剪辑能产生1032192种信使RNA(mRNA)转录子,每个转录子都能编码不同的蛋白质。
现在人们只知道酵母有三种基因可以选择性地拼接,而在人类至少35%的基因转录经历了选择性的拼接。遗憾的是人们对于调控这些选择性拼接的蛋白质(RNA)知之甚少,尽管人们已经知道拼接发生的位置和特殊的时间。
这表明,执行拼接的蛋白质的复杂性(可以称为蛋白质拼接组,spliceosome)自身也处于严格的控制之中,这种控制也许是通过其与其他调控蛋白相互反应而实现的。
另一种理论:渐成说
认识到不能用单纯的基因数量来解释生命现象的复杂性,也有研究人员认为应当用渐成说来解释。
所谓渐成说(Epigenesis,又译后生说)是相对于遗传说(Genetics)而言的,指的是基因功能发生遗传变化时,DAN序列并没有发生变化。渐成说与生命个体的发育和所有生命现象都预先由受精卵中的基因所决定的"先成说"相反,认为个体的发育是在各器官和各部分发育过程中逐渐形成的,而不是预先存在于受精卵中。
这种理论似乎更能解释为什么人与黑猩猩的基因数量和碱基对序列几乎完全一致,但两者的生命现象和创造力却大相径庭。渐成说同样涉及RNA开启和关闭基因的作用。因为细胞的分化、发育,生物的生老病死等就是一些基因关闭,而另一些基因表达(开启)的结果。
比如,在一些生物中含有一种以RNA为模板的RNA聚合酶,这种酶可以在细胞中形成双链RNA,后者容易被降解,因此可以起到特定基因被关闭的信号作用。由于某一基因或几个基因的关闭,生物性状和功能就会大不相同,此外,在细胞质中形成的双链RNA可以指导形成DNA的甲基化。
反过来,以甲基化的DNA为模板合成的异常的RNA又可以促进其他部位的DNA甲基化。研究早就发现,DNA的甲基化是生物关闭基因表达的一种有效手段。
渐成说的另一个内容是研究DNA重复序列之间的相互作用,以及为什么一些基因会产生沉寂现象,即不表达出来,也就不能编码和产生蛋白质。
对真核生物的研究发现,DNA重复序列可以诱导突变的产生,而且与DNA的甲基化有关。实际上这是生物的一种自我保护功能。当外源性DNA进入一种生物体后,这些进入生物体的多余的DNA就会引发一些突变,然后DNA修饰酶会把DNA中的胞嘧啶修饰成5-甲基胞嘧啶。
随后再产生一些错义和无义的突变。这样的结果一是影响基因的表达,二是阻止基因同源重组的发生。
同时,DNA的甲基化也可以通过减数分裂时的同源染色体的配对而相互传播。由此便使得一些基因表达出来,而一些基因沉寂下去,生命的现象、表现形式和功能便变得复杂和多样化起来。
这远不是基因数量的多少所能解释的。
谢谢。收起