请教关于从上海前往台湾在香港转机的三个行程的问题

  我手里有中华民国台湾地区出入境许可证、中国大陆护照、中国大陆身份证、中国大陆往来港澳通行证（含两次香港签注）这四个证件。行程一：日期 路线 航班 出发-到达05-27 上海浦东—深圳宝安机场 ? 09:00—? 05-29 香港—台北桃园机场 CX472 15:55—17:4005-25 台北桃园机场—香港 CX469 10:20—12:0005-27 深圳宝安机场—上海浦东 ? 16:00—? 行程二：日期 路线 航班 出发-到达05-27 上海浦东—香港 CX365 09:45—12:2505-27 香港—台北桃园机场 CX472 15:55—17:4005-25 台北桃园机场—香港 CX469 10:20—12:0005-27 深圳宝安机场—上海浦东 ? 16:00—? 行程三：日期 路线 航班 出发-到达05-27 上海浦东—香港 CX365 09:45—12:2505-27 香港—台北桃园机场 CX472 15:55—17:4005-25 台北桃园机场—香港 CX469 10:20—12:0005-25 香港—上海浦东 KA896 16:05—18:35以上这三个行程是否都可行？不会有证件上的问题？假如我从上海飞深圳再从深圳入境香港转机去台湾的话，要用什么证件入境呢？如果使用港澳通行证入境香港的话，是否必须7天之内从香港出境呢？我从香港转机去台湾，至少要在台湾呆将近一个月，显然无法在7天之内从香港出境。
  请熟悉相关政策的达人指点。非常感谢。。