这样的增值税发票能抵扣吗?
发票应如实填开，特别是增值税专用发票，如有虚假，被税务局查出后双方都要受处罚的。如果对方开具的是工业企业普通发票，你单位也不能抵扣，只能按收取普通发票入库。
那要看对方是什么性质的纳税人，如果对方是商贸企业，我觉得对方这样提供专用发票是违反增值税专用发票使用规定的；如果对方是工业企业，那么这批商品的生产原料由谁来提供？对方是只收加工费么？
从您表述的意思看，好像对方企业也是商贸企业，他给贵企业生产企业发票显然是违反相关规定的（对方企业这样做是违规的）。
而违反规定取得的进项发票是不能抵扣的。
另外，不论可不可以抵扣，我认为并不影响商品的入库。只不过不能抵扣进项税金，您的企业会有一定的损失，即多缴纳一些税款。