全肠道细菌菌落和密度各不相同的因素(1)胃酸杀死了大部分吞入的微生物；(2)小肠的快速运动保持了小肠的细菌计数低；(3)粘液分泌通过捕获和推动细菌而增加了细菌的清除；(4)不同的pH值和氧压利于不同微生物的繁殖；(5)饮食营养影响不大；(6)回盲瓣针对防止回肠细菌移位起非常主要的作用；结肠运动缓慢利于大量微生物的存在。
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