宁波大学医学院附属医院的前身是宁波市第三医院，创建于1951年5月，是一所集医疗、教学、科研及预防保健为一体的三级乙等综合性医院、省文明医院、爱婴医院、绿色医院、市平安医院、国际紧急救援中心网络医院。
宁波大学医学院附属医院核定病床800张，设有内、外、妇、儿、重症监护室等24个病区及手术麻醉科，开设60多个专家专科门诊及检验、影像、超声、药剂、病理等医疗辅助科室。医院现有职工955人，高级职称155人，中级职称244人。近年医院在人才培养和引进上加大力度，心血管内科、妇产科、骨科、肿瘤科均引进了博士或博士（后），全院有硕士以上高学历人才54人，其中3人享受国务院特殊津贴。
建筑面积50000平方米、高20层的汤于翰医疗中心(1号楼)配备有物流传输系统、中央空调系统、空气净化系统和智能化弱电系统以及综合布线、楼宇自动控制、医学示教闭路传输系统等，充分体现了整座大楼的智能化水平。医疗中心的装饰颜色，根据不同的病区分为粉红、桔黄、浅绿等系列，展示了人文化和艺术化的有机结合，给人以温馨的感觉。病房以二人房间为主，每间病房都有独立卫生间，并装配了有线电视、电话等设施，贵宾房更可以连接宽带上网。每个病区还有专门晾晒衣物的区域，让病人的住院生活更加方便。医疗中心从人性化的设计出发，少有限度简化就诊流程，在门诊每个层面都设有专门的候诊区，电脑叫号显示屏显示，使患者能在宽松、安静的环境中等候就诊。门诊布局充分考虑保护病人隐私的需要，所有诊室均设计为单人就诊，使医生与病人一对一的交流。老住院楼（2号楼）于2007年9月完成装修改造后，进一步加强了医院的诊疗能力。
宁波大学医学院附属医院规模的扩大带来医疗设备的更新，目前医院拥有核磁共振、螺旋CT、DSA、带TV大型Ｘ光机和数字胃肠X光机、全自动生化仪、全自动5分类血球计数仪、各类手术内镜、人工肾、全自动人工呼吸机、全自动监护系统、惠普8500彩超和美国多普勒超声仪、多导睡眠呼吸监护系统、全能麻醉机、肺功能测定仪、高能聚焦超声刀、床旁持续肾替代装置等大型现代化医疗设备。
在医疗业务方面，医院确定骨外科、心血管内科、呼吸内科、消化内科、普外科(普外科与腹部微创外科联合共建)、肿瘤外科、妇科、产科、儿科、耳鼻咽喉科10个科室为临床重点学科，神经外科为临床重点扶植学科。脊柱外科作为宁波市的“医学特色专科”，在脊柱创伤方面开展了一系列新技术新项目，对脊髓急性损伤、高位截瘫的抢救成功率高，颈、腰椎微创手术在市内领先；创伤骨科开展断肢（指）再植、皮瓣移植、关节置换和复杂性创伤性骨折手术；心血管内科对心血管疾病的治疗采用非介入治疗、介入治疗、临床电生理等先进手段；耳鼻咽喉科的喉癌根治术及发音重建术达国内先进水平，该科还开展了人工耳蜗植入手术，是澳大利亚人工耳蜗公司在华定点手术单位之一。肝胆内镜外科于1992年1月在省内率先开展腹腔镜下胆囊切除术，随后又相继开展了腹腔镜下肝切除、肾切除、脾切除等手术及十二指肠镜和胆道镜治疗；妇科开展的子宫、卵巢、输卵管等内镜手术在省内乃至华东地区享有盛誉；整形美容外科成立近20年来，先后开展了头皮再造、乳房再造、四肢整形、皮肤软组织扩张及头面部系列美容等各类手术，多项技术达国内先进水平；泌尿外科开展肾移植及各类内镜手术和体内外碎石治疗。2007年，骨外科学被市卫生局评为新一轮医疗卫生重点建设学科，护理学被评为重点扶植学科。2008年11月，“卫生部妇科内镜诊疗技术培训考核基地”落户我院。
宁波大学医学院附属医院在加强自身科室建设同时，积极拓展渠道与兄弟医疗机构合作。2007年9月，医院与上海新华医院签约，共同成立“宁波大学医学院附属医院－上海交通大学附属新华医院儿科中心”。该中心设门急诊区及两个住院病区，近百张床位，涵盖小儿内科、外科及重症监护等各方面。新华医院专家定期到中心坐诊、查房、教学及科研合作，将上海儿科医疗的发展成果惠及甬城儿童。同年10月，医院又与浙江大学医学院附属妇产科医院签约，结为技术协作医院，两院在妇产科医疗、教学、科研、预防和保健等方面实现资源共享和互补，更好地为人民健康服务。
近年来，宁波大学医学院附属医院有二十项科研成果通过省、市级鉴定并获奖。