经国资委批准2004年12月31日位于北京市石景山区京原路的原中铁建总医院从企业中分离整体划转并入北京朝阳医院成立北京朝阳医院京西院区是石景山地区单一一家非营利性三级甲等综合性医院
经过近一年的停业装修改扩建更新医疗设备460余台（套）进行人员培训和面向国内外招聘引进学科高端人才于2005年3月28日开诊试运行首批开设550张病床其中重症监护病床32张经过一个多月的试运行各项医疗工作运转正常于2005年5月19日正式开院并举行了隆重的开院庆典仪式党和国家领导人何鲁丽吴阶平韩启德给医院发来了贺信和贺电；卫生部副部长黄洁夫北京市副市长牛有成等各级领导亲临会场为京西院区的开院发表了热情洋溢的讲话对京西院区的建设和发展提出了明确的要求并寄予了厚望
京西院区依托朝阳医院本部强大的学术学科和人才资源优势资源共享科室设置齐全拥有一批高水平的医疗知名专家学者与学科带头人在高水平综合医院基础上突出专科特色重点打造呼吸中心心脏中心重症监护中心急诊中心职业病与化学品中毒救治中心等优势学科和干部综合科脑病中心肾病中心肝胆中心等特色科室同时承担突发性公共卫生事件的应急功能
京西院区以“博爱诚信”为立院之本坚持以病人为中心以提高医疗服务质量为核心竭诚为广大患者提供人文优质的医疗服务