哈尔滨医科大学的优势学科或者是特
临床医学、预防医学、麻醉学、医学影像学、药学专业是国家特色专业；基础医学、临床医学、口腔医学、麻醉学、医学影像学、预防医学、公共事业管理、药学、护理学、生物技术是黑龙江省重点专业。
临床医学（5+3一体化）专业，我校于1988年开始试办七年制高等医学教育，是国家首批举办七年制临床医学本硕连读专业的院校之一。 2015年，教育部将七年制临床医学专业调整为临床医学专业（“5+3”一体化），即本科5年培养合格者，直接转入我校与住院医师规范化培训有机衔接的3年临床医学硕士专业学位研究生教育阶段。
基础医学（5+2本硕连续培养）专业，我校于1996年由原国家教委批准成为“国家理科基础科学研...全部
临床医学、预防医学、麻醉学、医学影像学、药学专业是国家特色专业；基础医学、临床医学、口腔医学、麻醉学、医学影像学、预防医学、公共事业管理、药学、护理学、生物技术是黑龙江省重点专业。
临床医学（5+3一体化）专业，我校于1988年开始试办七年制高等医学教育，是国家首批举办七年制临床医学本硕连读专业的院校之一。
2015年，教育部将七年制临床医学专业调整为临床医学专业（“5+3”一体化），即本科5年培养合格者，直接转入我校与住院医师规范化培训有机衔接的3年临床医学硕士专业学位研究生教育阶段。
基础医学（5+2本硕连续培养）专业，我校于1996年由原国家教委批准成为“国家理科基础科学研究和教学人才培养基地”，于1997年开始招收本硕连读基础医学专业学生。
基础医学为人类疾病的防控与诊治提供坚实的理论基础和技术指导，是现代医学的基石。
卫生监督专业，我校依托优越的办学条件、经验和社会需求，于2012年在国内率先开办本科卫生监督专业，为国家培养卫生监督行业专门人才。
临床药学专业，随着医药卫生改革不断深入，学校根据社会需求和学校办学实力，于2008年开设临床药学专业，是国内第一家开设临床药学专业的医学院校，学校充分发挥基础医学和临床医学的教学优势，建立通科教育+专科培训的培养模式，人才培养质量受到用人单位的好评。
生物信息学和生物技术专业，生物信息学是利用基因组、蛋白质组等高通量生物医学大数据进行生物表型或重大疾病系统性研究和产业开发的前沿朝阳学科。2003年学校率先开设生物信息学本科专业，经过十余年的建设，生物信息学教育教学水平处于全国领军地位。
学校于2008年率先开设生物技术专业（生物医学软件工程方向），是国内具有特色的计算科学与生物医药科学相结合的专业之一，为以大数据为驱动的现代国家生物医学发展和产业竞争做出了突出贡献。该专业毕业生主要赴中科院所、国内著名高校、著名生物企业等单位深造或工作。
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