何贤纪念医院前身是番禺区妇幼保健院建于1965年3月8日，由番禺县卫生防疫站妇幼组析出组建，院址设在市桥镇大西路，建院初期建筑面积80平方米，工作人员14人，病床14张，承担妇女、儿童保健任务。1983年邑人何贤捐资450万元人民币、番禺人民政府拨款50万元，在市桥镇清河东路另建新院，定名何贤纪念医院。此后，该院两个名称同时使用。
20世纪80年代末，该院已发展为一间具有一定规模的医院承担全县妇幼保健、医疗、教学任务。医院占地面积12100平方米，建筑面积12300平方米。卫生技术人员201人，其中具有中级职称7人。设儿童保健、妇女保健、中医、西医、妇科等门诊及儿科、妇科、产科、内科4个住院病区。病床115张。医疗设备有X光机、心电图机、B型超声诊断仪、人工心肺杨及妇产科检查设备一批。1984年，承担番禺作为联合国儿童基金会在我国开展的每二周期妇幼卫生示范县任务。
20世纪90年代，该院已逐步建成一所集医疗、保健、康复、教学、科研于一体的综合性医院。该院1994年被广东省卫生厅评为二级甲等医院。1995年被卫生部评为爱婴医院。1998年被广东省卫生厅评为二级甲等妇幼保健院。
2003年，该院占地面积14152.5平方米。在编职工545人，其中卫生技术人员472人，具有高级职称61人，中级职称70多人。医院一高有内科、外科、产科、妇科、儿科、生殖医学科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、皮肤科、医学美容科、中医科等临床科室。配置有全身CT扫描机、小C臂数字减影X光机、电子纤维内窥镜系列、腹腔镜系列、三维彩色B型超声诊断仪、体外碎石机、全自动生化分析仪等先进医疗设备。
踏入21世纪，在各级领导和港澳同胞的关心、支持下，何贤纪念医院继续大胆探索，改革创新，在综合性医院的平台上发展妇幼保健事业，现已发展成为一所以妇科、产科、儿科及生殖医学科为“龙头”，集医疗、保健、科研、教学于一体的多学科、多病种全面发展的综合性医院，1994年和1998年分别通过了国家二级甲等综合性医院及二级甲等妇幼保健机构的评审，成为国内少见的双“二甲”医院。
二十年来，何贤纪念医院重视医院的内涵建设，提高医疗质量和服务质量，医院的医疗业务量不断增加，年门诊量超过96万人次，年住院病人在1.84万人次以上，近几年医院固定资产以每年超过10%的速度增长，医院的综合实力不断增强。
环境优雅，布局合理。医院占地面积 1.2 万平方米，医疗业务用房面积3万多平方米，开放病床500余张，环境优美，布局合理；逐步实现信息化管理，优化流程，为病人提供快捷、方便的医疗服务。
人才济济，学科齐全。医院现有高级技术职称人员113名（其中正高10名），中级技术职称人员230名；临床及妇幼保健科室齐全，开设一级学科21个、二级学科45个，设有专家、专科门诊46个。2006年，番禺区重症孕产妇救治中心、番禺区重症儿童救治中心在何贤纪念医院成立。
设施完善，设备先进。医院配置有四层螺旋CT机、全数字化乳腺X光诊疗系统、C臂数字减影X光机、电子内镜、腹腔镜、三维彩色B超、体外震波碎石机、全自动生化分析仪等先进的医疗设备。
技术精湛，管理科学。何贤纪念医院产科、新生儿科是番禺区重点学科，心血管内科、消化内科、泌尿外科、骨外科、妇科肿瘤、生殖医学科、小儿肾病、妇女儿童保健等专业已经初具特色，学科建设逐步完善，专业特色不断增强。外科1993年成功开展了番禺地区首例断肢再植手术；先后成功开展了亚洲第六例骶神经刺激器植入术和广东省首例人工尿道括约肌植入术； 1995年，率先在本地区引进腹腔镜技术，目前每年开展腹腔镜手术超过500例，居番禺地区第一位。内科开展了逆行胰胆管造影、十二指肠乳头括约肌切开胆管取石、金属支架植入治疗胆总管狭窄、纤维支气管镜下肺泡灌洗、临时及长期性心脏起搏器植入术、心导管室速射频消融治疗、急性心梗溶栓治疗、血液净化治疗、肿瘤超选化疗等先进的技术项目。妇产科年分娩量达4200多人次，居广州地区医院的前列；开展分娩前后一条龙服务，建立了胎儿中央监护系统和孕产妇重症监护室（MICU），竭力确保母婴安全；开展了腹腔镜、自凝刀等先进的微创治疗技术；拥有国际先进的全数字化乳腺X光诊疗系统，可早期发现和早期诊断乳腺癌，从而及时采取保乳手术进行治疗，不仅挽救了病人的生命，而且提高了患者的生活质量；开展的夫精人工授精技术通过了广东省卫生厅的专项技术评审，为不孕不育夫妇带来福音。儿科配备有先进的监护和治疗设备，建立了新生儿重症监护室（NICU），开展了新生儿全血置换术、肺表面活性物质替代疗法防治新生儿肺透明膜病、新生儿床旁血气分析、儿童哮喘病的吸入治疗等诊疗项目，提高了儿童和新生儿疾病的救治水平。保健科担负全区儿童和妇女两大系统保健工作的指导和管理职能，建立了全区妇幼保健网络系统，为降低孕产妇和围产儿死亡率作出了应有的贡献。
1992年以来何贤纪念医院获广东省、广州市、番禺区科委立项的科研项目60多项，有3个科研项目获得广东省、广州市科技进步奖，2个项目获得专利。1998年以来有300多篇医学论文刊登在全国各级医学杂志上。2002年通过了广东省高等医学院校教学医院的资格评审。2001-2004年连续四年被评为番禺区文明单位。2007年广东省健康教育项目的孕期健康教育中心在何贤纪念医院落户。婚前检查项目被指定为番禺区单一免费婚检机构，成为广州地区婚前保健工作示范点。多年来，何贤纪念医院产科分娩量居广州市各医院前列，曾荣获广州市区级产科质量评比第一名。医院先后被评为广州市价格诚信单位、番禺区文明单位和医疗卫生先进单位等称号。在中国疾病预防控制中心妇幼保健中心《2005年全国县（区）级28个省1965家妇幼保健机构资源与运营情况调查分析报告》中，何贤纪念医院在专业设备、固定资产、年业务收入、实有床位数、年门诊诊疗人次数、出院人数等7个项目排名第一，妇幼保健整体综合实力位居全国同行前列。
