前身为昆明红十字会医院（1965年改为昆明市第三人民医院），始建于1928年，1970年由昆明搬迁至曲靖，改名为云南8511医院，隶属云南省国防科工办，1986年移交曲靖地区，改名为曲靖地区第二人民医院，1997年撤地设市，更名为曲靖市第二人民医院，经云南省卫计委2015年3月20日正式批准为集医疗、教学、科研、预防、保健于一体三级甲等综合医院。为四川大学华西医院/华西第二人民医院区域联盟网络医院，是云南中医学院附属曲靖综合医院、曲靖医学高等专科学校的非直属附属医院，2014年5月6日复旦大学附属中山医院对口援建曲靖市第二人民医院正式启动，承担着全市638万人民及周边地区人民的医疗救治和突发公共卫生事件救治等任务。医院占地面积56亩，业务用房面积87902m2，设有机关职能科室20个、临床专业科室28个，医技科室10个。其中肝胆外科于1991年2月率先在中国开展了“腹腔镜胆囊摘除术”，享有“中国微创外科发源地”的美誉。全院现有职工1197人，在编人员510人，其中专业技术人员473人，教授30人，副教授98人，讲师197人，硕士研究生35人，享有国务院特殊津贴1人，省政府特殊津贴2人，市政府特殊津贴8人，市级突出贡献专业技术人员6人，市中青年学术技术带头人7人，曲靖市首席专家8人。医院编制床位数800张，拥有1.5T超导核磁共振、多排螺旋CT、ECT、DSA、C臂X光机、DR系统、全自动生化分析仪等设备，2007年建成曲靖市首家静脉药物配制中心。2011年，建成省内一流的净化手术室、数字化手术间及影像传输系统满足临床及学术需要，同年建成省内首家药房自动化和小车轨道物流配送系统。2009年以来先后获评“全国五一劳动奖状单位”,“全国医药卫生系统先进集体”,2009年、2012年连续两届荣获“省级文明单位”。系上海消化内镜诊疗工程技术研究中心曲靖基地、暨南大学微创外科研究所基地、广州国际减重与外科治疗中心曲靖基地；上海消化内镜诊疗工程技术研究中心?中山医院?曲靖市二院合作中心、云南省住院医师规范化培训基地；系曲靖市微创外科临床诊疗中心、曲靖市眼科疾病临床诊疗中心、曲靖市健康体检中心；肝胆外科、临床护理专业为曲靖市临床重点专科；普通外科、血液内科、消化内科专业为云南省省级重点专科建设项目。四级妇科内镜技术、经皮冠状动脉介入技术、永久性起搏器植入技术等12项二类技术获准机构和人员资质准入。2007年以来有30余项科研成果获省市级科学技术成果奖，其中2014年肝胆一外科《腹腔镜肝叶切除的临床研究》荣获云南省政府科学技术奖三等奖。
