医院前身为河南省干部疗养院，早在五十年代即开始治疗结核病，为河南省历史最早的专业治疗结核病的医院，至今治疗结核病已达90余万人次。
1972年被省政府命名为河南省结核病医院，设结核病床400张，分结核内、外科，在全国率先开展了定向肺导管技术，并参与全国短程化疗研究。
1982年更名为新乡医学院二附院，保留结核内科病床200张床位，结核外科并入新乡医学院一附院。1988年新乡医学院一、二附院合并为一附院，仍保留结核病床200张，分内一、内二、内三、内四四个科室，合并后因有综合医院为依托，一方面为快速诊断患者病情、帮助其早日康复奠定了基础，另一方面，凭借豫北地区较先进的医疗设备和强大的专业人员优势更有利于临床科研工作的开展。2003年，医院结核病科恢复使用河南省结核病医院名称，保留结核病床位200张，分为四个临床科室以及结核病防治科、结核病研究所等，除开展结核病的诊治外并承担院内及科研项目。
医院现有高级职称24人，其中主纫浇师8人，副主纫浇师16人，硕士研究生6人，主忠浇师12人，主管护士20人，并有结核病研究所（1987年由省教委批准成立）和8名专职人员，下设细菌研究室、药物研究室、细胞免疫研究室、内科研究室，开展的检测项目有：结核菌涂片、培养药敏外，L型结核菌的检测，α-肿瘤坏死因子、γ-干扰素、β2微球蛋白的检测，结核菌噬菌体的检测，并异烟肼、利福平血药浓度检测，这些项目的开展为结核病人合理用药早日康复提供了用药依据。在参加国家十五攻关研究的17家医院中，唯独医院一家给病人减免药费，这充分证明了医院以病人为中心的服务理念。
近年来，医院不断加大对结核病区的资金投入，投资800万元兴建五层结核病区楼，病区为花园式建筑，病人就医条件进一步改善。结核楼内配备了胸腔镜，纤维支气管镜（开展了经纤维镜介入治疗肺结核），结核菌快速培养仪，肺功能测量仪，进口呼吸机，心电图监护仪，彩色多普勒，黑白B超，设备齐全，应有尽有。由于医们医疗条件进一步改善，人员技术水平不断提高，结核科于2002年被河南省卫生厅评为省特色专科。
河南省结核病医院、省特色专科今后一个时期的研究方向为：难治性肺结核的防治，难治胸膜炎的治疗。自2002年10月参加了国家科技部十五攻关课题，化疗加免疫治疗耐多药肺结核研究，中药芪甲补阴利肺胶囊治疗肺结核的研究，近年来共发表、省级专业性论著400余篇，取得科研成果6项。
病人不仅来自全省各地，周边省如河北省的魏县、涉县、邯郸、磁县，山西省的长治、晋城、凌川、山东聊城、阳谷、合济、莘县、安徽省宿县、亳州，以及内蒙，甘肃，四川，黑龙江，新疆等地患者纷纷舍近求远慕名而来。每年节假日医院实行无假日门诊，过节期间，专家教授不休息，并对就诊患者实行免挂号费及检查费减免20%的优惠政策。