北京中医药大学东方医院是北京中医药大学第二临床医学院，是国家中医药管理局直管单位，是全国三级甲等中医医院。教育部211工程建设的单一一所中医药大学附属医院，是北京市医疗保险定点医院。总占地面积31231.62平方米，已建筑面积87264平方米，由医疗主楼、医疗南楼、教学科研楼、制剂楼及配套设施组成。
北京中医药大学东方医院是一所特色明显、功能齐全、设备先进，集医疗、教学、科研、预防和健康咨询为一体的现代化大型综合性中医医院。院内共开放床位643张，日平均门诊量4500人次，设有临床科室37个。医院技术力量雄厚，诊疗方法是以中医为主、中西医结合，中医特色突出。有周平安、陈淑长、王沛等全国知名专家、教授应诊，还有一大批中年学科、专科带头人出诊查房。
北京中医药大学东方医院重视发展中医，特色鲜明，优势明显。各科室开展的中医特色疗法近百种，以低廉的价格和良好的疗效在广大患者中享有盛誉。如：中药保留灌肠治疗溃疡性结肠炎；中药离子导入治疗盆腔炎、痛经、子宫内膜异位症；药罐疗法治疗局部肌肉疼痛以及带状疱疹后遗神经痛等。根据中医“治未病”理念，针对现代亚健康人群不断扩大的形势，东方医院于2008成立了治未病中心，用传统的中医方法，内调外养，达到预防保健的效果。
医院有国家中医药管理局重点专科（病）项目6个，分别是脑病科、肾病科、心血管科、妇科4个专科和青盲（眼科）、周围血管病（动脉硬化闭塞症）2个专病。北京市中医诊疗中心有脑病科、呼吸热病科、儿科。
北京中医药大学东方医院作为北京中医药大学第二临床医学院，为国家培养了一批高素质专门人才。学院现设有中医内科专业、中医外科专业、中医妇科专业、中医儿科专业、针灸推拿专业、中西医结合临床专业等11个招生专业，建有中医学、中西医结合博士后流动站，现有博士学位授权点6个，硕士学位授权点11个，共设内、外、妇、儿等18个教研室，拥有临床实习床位643张，是全国中医药高等教育学会临床教育研究会的常务理事单位等。现共有博硕导师近100名，有7名专家享受政府特殊津贴，有3名专家被国家确定为师承制教育导师。目前，我院承担有我校七年制临床方向、科研方向班及“北中医-新加坡南洋理工大学合作双学位项目”班临床课授课、毕业实习，五年制学生毕业实习等教学任务。
围绕中医药防治重大、疑难、常见疾病主题开展了科学研究480项，包括科技攻关/支撑计划课题、973计划课题、国家重大新药创制科技专项、国家自然科学基金项目、中医药行业专项课题等项目43项，获各级科技成果奖35项。2009年获国家中医药管理局细胞分子技术三级实验室称号。目前拥有6个北京市名老中医工作室站建设项目，承担教育部“211”工程三期重点学科建设项目，是国家中医药管理局重点学科、重点研究室建设单位。
医院还配有现代化的手术室、监护室以及健身、药浴、功能康复等设施。医院装备有先进的大型医疗设备：如64排螺旋CT机、核磁共振、DSA血管造影机、ECT单光子发射计算机断层扫描系统、数字化胃肠X光机、彩色多普勒超声、超声心动图仪、生化分析仪等。