吴江市第二人民医院的前身是1970年6月28日成立的吴江县血防治疗组，1972年6月成立平望地区医院，1984年12月30日更名为吴江县第二人民医院，1992年5月4日随吴江县撤县建市改名为吴江市第二人民医院。
1987年9月经苏州市编委，苏州市卫生局批准，床位数由150张增加到170张，人员定编261人。2005年7月13日，根据吴江市委，市政府及市卫生局的统一部署，原吴江市中医院与原吴江市第二人民医院整体合并，成立新吴江市第二人民医院，目前已基本平稳过度。
吴江市第二人民医院是卫生部国际紧急救援中心认定的急救医院；是苏州市白求恩杯竞赛先进单位，吴江市文明单位。
医院现有床位300张，在职职工412人，其中卫技人员336人，高级职称人员30人；离退休职工134人。
医院占地19085平方米，其中医疗区占地15057平方米，本部占地11411平方米；医院建筑面积26410平方米，其中医疗业务用房17227平方米。百万元以上设备1台，五十万元以上设备4台，十万元以上设备25台；医院固定资产为6036万元。
目前吴江市第二人民医院有临床科室9个，门诊科室12个，医技科室5个，中西药房及中西药制剂室各一处，其中，痔瘘科为苏州市重点中医专科，骨科为吴江市重点专科，皮肤科为吴江市特色专科。具有自制药品38个品种。准备再开放妇产科，中西医结合病区，痔瘘科病区和肾脏内分泌病区各一病区。
2005年（时间以2004年11月至2005年10月），我院完成门急诊199410人次，较2003年增长26.8%；出院人数10790人次，业务收入7210.2万元，出院病人数和业务收入均较2003年达到了翻番的水平。药品收入占业务收入比例为51.5%，取得了较好的经济和社会效益。
为进一步贯彻落实苏州市卫生局下发的《医疗救助实施细则》和吴江市卫生局下发的《吴江市困难人群医疗救助实施意见》和精神，我院结合医院和本社区的实际，初步制订了本院和一些惠民措施。
吴江市第二人民医院是体现政府对百姓关心，爱护的重要窗口，也是党和政府对人民群众体现温暖的重要纽带。吴江市政府为解决老百姓看病难，看病贵的问题，准备在我院挂牌吴江市惠民医院，这主要体现了吴江市委，市政府对吴江人民的关心和爱护，为构建和协吴江的重要民心工程，惠民医院将准备采取十免十减免等措施，以体现政府对低保特困人群，“四种病”的大病患者的关怀。
对来院就诊患者实行免挂号费，医院预计一年要少收挂号费30万元。
对70岁以上老人，学生，吴江市级以上劳模除免收挂号费外，另各种检查费减免10%，此项医院将减少收入80—100万元。
对平望镇区范围内的血透病人实行免费接送，对非平望镇区范围内的血透病人给予报销来回公交车费。
由于平望镇处于吴江市松陵及盛泽两个城区的中间，为更好地发挥吴江中心地理位置的功能，对于低保人群，特困人群来我院住院治疗的给予报销来回公交车费，如行动困难的人提供免费的接送。
吴江市第二人民医院的发展规划立足于对常见病，多发病的诊断治疗，以满足吴江人民群众基本医疗的需求。吴江二院地处吴江市中心，经多年的发展，目前已形成了以创伤外科及皮肤科为专科特色的综合性医院。
今年7月13日根据市政府决定，原市二院与原市中医院正式合并，资源进行整合，同时依托苏大附二院，宋庆龄基金会上海国际妇幼保健中心的支持和扶植，目前及今后一段时间医院将以创伤外科，皮肤科，痔瘘科，中西医结合内科及妇产科为发展重点。以大专科，小综合来规划我院的业务发展之路。