重庆三峡中心医院口腔分院成立于2012年3月，集口腔疾病诊断、治疗、保健、临床教学任务于一体，服务范围覆盖三峡库区及周边23个区县，专业设置齐全、是三峡库区唯一的一家口腔专科医院。年门诊人次8万余人，年住院病人1000余人次。分院分设口腔内科、口腔修复科、口腔正畸科、口腔种植科、口腔颌面外科、洁牙室、放射科、新城路综合门诊、百安分院口腔科、江南妇女儿童医院口腔科、健康管理中心口腔科及专家诊断室等配套科室。口腔分院自成立以来，注重引进技术人才，分院共有医务人员100余名，其中高级职称9名、研究生6名。
目前，口腔分院已广泛开展口腔各专科技术，如口腔种植技术、牙修复、无痛笑氧麻醉口腔治疗、牙冷光美白、根管治疗显微根管技术、牙周黏膜病系统治疗、儿童及成人各种牙颌面畸形矫治、语音治疗、口腔癌的综合治疗、头颈部组织器官修复重建、正颌外科手术、颜面疤痕综合治疗、颌面部血管瘤的无创和微创治疗、颌面部先天或后天畸形整形术及鼻下段美容整形术等。并拥有先进的德国西诺德牙科综合治疗椅、全景机、牙片机、皮肤微晶磨削机、牙冷光美白治疗机、YAG双波长激光机等先进设备。实行24小时全天侯接诊，以“健康口腔，至臻至美”的服务理念，积极打造最优区域性口腔医疗中心。
口腔分院是中华慈善总会“微笑列车”唇腭裂治疗项目定点医院、中西部地区儿童口腔疾病综合干预项目定点单位、“口福行动”的试点医院。曾被中华口腔医学会、微笑列车授予“优秀项目合作医院”荣誉称号。