北郊医院始建于1974年，经过几代人的艰苦努力，已发展成为集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的现代化二级综合医院。1995年被卫生部、联合国儿童基金会、世界卫生组织授予“爱婴医院”，2001年成为北京市首批医保定点单位，2007年被区卫生局确定为昌平南部区域性医疗中心，2008年被评为“平安医院”。
目前，医院为一院两址（分为综合和精神分院），医院占地总面积约10。2万平方米（其中总院4。8万平方米，精神分院5。4万平方米），日均门诊量约1500人次，实际开放床位1800张。开设综合临床科室46个，医技科室19个，专家门诊16个，特色专科门诊6个，精神病区12个。
随着医院周边常住人口的迅猛增加及日益增长的医疗卫生服务的需求，医院认真贯彻落实科学发展观，不断提高自身管理水平和医疗技术水平，积极参与新时期医院的医疗卫生体制改革模式的探索，和北京大学人民医院联合组建“医疗服务共同体”，与人民医院资源共享，逐步完善三级医疗卫生服务网；注重学科建设，加强特色专科建立，凭借医院内、外、妇、儿等综合科室的较强技术实力，在北京地区树立以诊治精神病合并躯体病症、精神病合并传染病为特色的专科优势；同时与中国人才研究会中医骨伤学会联合，设立一个中心，三个基地，即：《中国高等中医院校骨伤专业全国微创治疗中心》、《中国高等中医院校骨伤专业研究生教学基地》、《中国骨伤颈腰椎微创技术临床教学科研基地》、《中国骨伤病特需专家会诊基地》。
几代北郊人以“依法办院、精益求精、以人为本、诚信服务”的创业精神建设着北郊医院，以“务实、创新、和谐”为主题，书写着医院光荣的历史，还将以“团结奋进、再创辉煌”的豪迈气概，创造医院美好的未来。