醋酸白试验 由于HPV感染过的角朊细胞与正常的未感染过的角朊细胞的角蛋白不同，只有被HPV感染过的角朊细胞才能被醋酸致白，在可疑皮损处涂3%~5%醋酸1~5分钟，可见局部皮损粘膜变白，即为醋酸白试验阳性。此法敏感度较高但特异性较差，注意在涂醋酸时不要用力摩擦，以免擦破皮肤粘膜后造成假阳性，但假阳性变白处的界限不清或不规则，醋酸白试验阴性不能完全排除尖锐湿疣。
组织化学检查 取少量皮损组织制成涂片，用特异性抗人类乳头瘤病毒的抗体作染色。对于男性位于尿道内，在女性位于女性生殖道壁或宫颈部位的尖锐湿疣，以及位于膀胱内的尖锐湿疣，可以采用尿道镜、女性生殖道镜或膀胱镜来检查，并可结合组织病理提高尖锐湿疣的诊断率。此为有条件者可用PCR进行HPV分型检测。
