吃完扇贝会肚子疼的原因可能是因为扇贝中含有一种称为赤潮毒素的有毒物质。赤潮毒素是由一种称为赤潮藻的海洋浮游生物产生的，这种藻类会在一定条件下大量繁殖，导致海水变红，称为赤潮现象。

当人们食用了含有赤潮毒素的海产品，如扇贝、蟹、鱼等，就可能会引起食物中毒。赤潮毒素会损害人体的神经系统和肝脏，导致头痛、肌肉酸痛、恶心、呕吐、腹泻等症状，严重时甚至会危及生命。

因此，为了避免食用含有赤潮毒素的海产品，我们应该选择正规的渔业市场或超市购买，同时注意观察海产品的新鲜度和质量。如果出现了食物中毒的症状，应该及时就医并告知医生食用了哪些食品。