惠州市中医医院始建于1965年，是惠州地区唯一的三级中医医院，担负着全市中医药医、教、研、中医药保健、康复、养生、中医药制剂研制等重任，是具有中医和中西医结合特色的现代化综合性中医院，是广东省中医名院建设单位、国家重点中医院建设单位、南方医科大学非直属附属医院、广东省普通高等医学院校教学医院、暨南大学医学院教学医院、广东省中医院协作医院。
医院设菱湖和东江新城两院区。菱湖院区坐落在美丽的西子湖畔、菱湖之旁，现有编制床位400张，占地面积2.3万平方米，建筑面积2.5万平方米。东江新城院区位于惠州市大湖溪东江新城东升二路，是市委、市政府“八大民心工程”重点建设项目之一，占地面积5.9万平方米，建筑面积5.5万平方米，设床位500张。
作为惠州市中医药事业发展的“龙头”，中医名家汇集的主要阵地，惠州人民养生保健的主要场所，惠州市中医医院依傍美丽的东江、百草文化的罗浮山，努力传承中医药文化，发挥中医药简、便、验、廉的特色优势，服务于惠州和岭南地区百姓健康，在惠州市中医药事业发展进程中起到了重要的先锋作用。“崇德笃学敬业济世”的医院精神在这里生生不息、代代相传。
医院设急诊科、骨伤科、内科、外科、妇科、儿科、五官科、肛肠科、口腔科、ICU、针灸康复科等临床科室。医院狠抓专科建设和学科建设，积极开展创名院、建名科、树名医工程。目前，骨伤科是广东省中医药局“十一五”中医重点专科，内分泌科、针灸科、心血管科、脑病科、脾胃病科、妇科是广东省中医药局“十二五”中医重点专科建设项目，糖尿病科、妇科、针灸科是惠州市中医重点专科，脑病、心病是惠州市中医重点专病。医院在技术上追求精益求精，在服务上追求至善至美，在信誉上追求诚信可靠，赢得了广大患者的信赖和赞誉。
“十一五”以来，惠州市中医医院进入了一个新的历史发展时期，在学科建设、人才培养、教学科研等各方面都取得了显著成绩。尤其是东江新城院区的建设，为医院发展拓宽了空间，加快了医院实现美好愿景的步伐，开启了医院不断发展壮大、跨越发展的新篇章。