乌鲁木齐儿童医院（前身为乌鲁木齐市第一人民医院），成立于1934年2月，1988年经自治区卫生厅批准改建为儿童医院，1997年正式命名为乌鲁木齐儿童医院。
乌鲁木齐儿童医院总院位于乌鲁木齐市天山区健康路，占地面积1.2万平方米，分院位于乌鲁木齐市新市区河南东路，占地面积2.73万平方米。七十余年的医疗实践，几代医疗精英的不懈努力，使儿童医院成为全疆单一一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的综合性儿童医院，是爱婴医院、自治区级文明单位……
乌鲁木齐儿童医院目前形成了以小儿内科系统（如呼吸、消化、内分泌，心血管、肾病、血液、神经、康复、新生儿等）；小儿外科系统（如普外、新生儿外、骨科、神经外、泌尿外、眼耳鼻喉、小儿妇科等）；小儿医技检查诊疗系统（纤维支气管镜、电子胃镜、结肠镜、肺功能监测、脑电诊断、心电诊断等）以及小儿院前院内急救和重症监护系统等多个系统组成的“院有专科，科有特色”的多元化格局。创造了儿科疾病专业特色的众多第一。
○ 新生儿科和新生儿重症监护室（NICU）是新疆第一家无陪护治疗科室，诊疗技术先进，设备精良，在新疆医疗界独树一帜。
○儿童重症救治中心由院前急救、转运，院内重症监护（PICU）组成。是目前疆内单一一家专业小儿急救体系。
○小儿神经康复科是全疆规模少有、诊疗项目最完善的第一家专业科室，亦是新疆维吾尔自治区小儿残疾早期干预业务指导中心。数以万计的癫痫、脑瘫及其他脑发育问题在这里得到治疗。
○小儿外科是全疆单一的小儿专业外科，创造了新疆年龄最小患者外科手术治疗的业绩。目前，新生儿先天畸形诊治水平、小儿无创性腹腔镜手术等项目全疆领先。
○小儿纤维支气管镜诊疗中心：小儿呼吸系统疾病的支气管镜介入治疗在全疆尚属首例。小到不满周岁孩童气管异物的摘除到难治性呼吸道感染性疾病等，在这里通过介入治疗都能获得满意的效果。
○小儿哮喘诊疗特色突出，治疗水平直接与国际先进水平接轨。“哮喘门诊”、“哮喘之家”的开展大大方便了全疆哮喘患儿诊治和预防知识的传播。
○小儿胃镜、肠镜诊疗技术的运用使小儿消化科快速发展，小到出生7天的婴儿到疑难危重的消化系统疾病，均可以在胃、肠镜的帮助下得到诊治。
○儿童保健因有强大的儿科临床做基础，已成为全疆为数不多的专业科室之一。儿童营养、发育、心理等方面的保健均属前沿。
○小儿耳鼻喉科、小儿眼科、小儿口腔科、小儿妇科均在全疆享有声誉，极富特色。
○小儿骨科初具规模，小儿矫形、小儿外伤手术治疗特色突出。
○小儿皮肤科、小儿内分泌科、小儿中医科不断发展，茁壮成长。
乌鲁木齐儿童医院目前年门诊量达到近70余万人次；年出院病人达到了2.5万次。
近年来，乌鲁木齐儿童医院十分重视科教兴医工作，把此项工作放在医院的重要议事日程作为大事来抓。近三年，医院在市级科技局、市卫生局科研立项多项，近年来获科技进步二等奖一项，三等奖两项，取得科技成果四项，通过市科技局计划课题验收三项；2008年申报市科技局计划项目五项，市卫生局计划项目三项。近三年来，医院中级以上专业人员在正式期刊上共发表论文120篇，著书2本，其中刊物53篇。医院引进、应用、推广新技术、新项目41项，医院近期加大重点专科、重点学科组建设，并在年终对重点专科、重点学科组进行考核，对表现突出的科室及学科组进行奖励。在继续医学教育方面，近三年来，医院共举办、省级、市级各类学习班21期，举办儿科免费进修班4次，并连续三年承担了乌鲁木齐地区儿科、公共卫生继教基地。承担新疆医科大学临床医学教学任务20余班次。
乌鲁木齐儿童医院随着医疗体制改革的不断深入，在文化建设、对外交流、人才培养、院容院貌、技术引进上加大投入，先后与北京、上海、广州、重庆等数家儿童医院建立友好关系，形成了强大的技术储备和可持续发展的活力。科研、教学能力也在不断提升，为打造全疆一流的妇女儿童专科特色突出的现代化医院而努力奋斗。
