鄂尔多斯市第二人民医院是内蒙古西部单一的一家传染病专科医院，承担着我市140万多人口及周边地区的传染病防治任务。始建于1990年，历经十几个春秋寒暑，在上级有关部门的重视和大力支持下，全院职工精诚团结、艰苦创业，坚持科技兴院方针、加强传染病专科建设，今天已发展成为一家布局合理，专科设置齐全，业务技术及管理水平一流的集医疗、教学、科研、预防于一体的传染病专科医院。
2001年8月与全国少有的传染病专科医院——北京佑安医院建立协作关系，成为该院挂牌分院，使我市患者“足不出市”，就能得到国内知名专家诊治，被群众誉为“百姓医院”。
鄂尔多斯市第二人民医院占地面积12100㎡，建筑面积6200㎡，正规编制床位120张，目前总资产953万元，正式职工105人，在岗93人，卫生技术人员82人，占全院在岗职工人数的88.2%，其中高级职称12人，中级中称（含医、护、技）37人。 医院环境优美，病房宽敞、舒适、明亮，装备有线电视和外线电话，并设有导医、导诊服务，全年提供全天侯专家门诊，为病人创造优质、高效、方便的医疗条件。 医院设置临床科室7个：门诊部、肝病科、结核科、肝病妇产科、肝胆外科、麻醉手术室。
鄂尔多斯市第二人民医院医技科室9个：B超室、检验科、放射科、中药制剂室、心电图室、电子胃镜室、人工肝治疗室、理疗室、供应室。 行政科室7个：党支部、办公室、人事科、医务科、护理部、财务科、总务科。现有临床医疗设备：人工肝治疗仪、肝病治疗仪、呼吸机、心电监护仪、血疗仪、氦氖激光治疗仪等。 检验设备有：全自动血球计数仪、全自动基因扩增仪、洗板机、全自动尿分析仪、全自动生化分析仪、全自动血流变分析仪、全自动血凝仪、全自动酶联仪，钾、钠、氯火焰光度计等。
鄂尔多斯市第二人民医院影像设备有：500毫安X光机，进口彩色B超、奥林巴氏心电图机、电子胃镜等。 教学设备有：多媒体教学系统，投影仪、幻灯机。 医院为内蒙古工医药专修学院教学医院；鄂尔多斯市卫校教学工医院；市、区二级医保定点单位；市、区二级“文明医院”。
长期以来，鄂尔多斯市第二人民医院凭借精湛的医技和优质的服务赢得了区内外患者的信赖，取得了良好的之社会、经济效益。
辉煌成绩的取得，取决于医院有开拓创新的坚强领导班子、勇于奉献的中层领导干部和默默无闻的专家群体，且有全国各大传染病专科医院强强联手，我们始终坚持“患者第一、质量第一”和“全心全意为人民服务的办院宗旨”。
针对目前严重危害人民健康的几大传染病（如肝炎、结核、性病等）重点研究，勇于实践，鄂尔多斯市第二人民医院开发出一整套中西医结合治疗肝病的药物：如复肝丸、乙肝丸、脂肝乐等；推出“结核病中西医结合综合治疗方案”，提高了难治、复治性结核的治愈率；；肝病妇产科对患有“乙肝”的孕、产妇，有一套科学严谨的母婴阻断治疗方案；肝、胆外科对肝炎后肝硬化、门脉高压的病人出现上消化道出血、脾功能亢进等行门脉分流及断流术，填补了本地区的一项空白；对肝癌患者做射频消融治疗，此项技术国内领先；性病科是我市卫生行政部门单一指定的、全市传染病诊治最规范的医疗机构。
“雄关漫道真如铁、而今迈步从头越”，在新的世纪里，鄂尔多斯市第二人民医院将信心百倍，更加努力，一如既往地坚持“以人为本、科技兴院”的原则，在各级政府和行政领导部门的亲切关怀下，我院于全国传染病届同行交流合作，并诚肯接受社会各界朋友的意见和监督，为我市及周边地区的传染病防治事业的健康发展作出更大的贡献。