新疆自治区中医院暨新疆医科大学附属中医医院、新疆中医药研究院及新疆中医名医名方研究开发中心，目前是中国西北地区规模少有的综合性三级甲等中医医院。
新疆自治区中医院现有59个临床医技科室，2个门诊部、2个分院和1个戒毒康复中心，编制床位1300张，开放床位2200张。有设备先进的ICU、CCU重症监护病区，有先进的核磁共振、多排CT、血管机等医疗设备。医院外科住院楼、内科病房楼和门诊楼设施完善、环境舒适，为患者提供了更好更便捷的服务。
新疆自治区中医院现开设有内、外、妇、儿、针灸、推拿、急救等45个诊疗科室，其中三个专科一个专病：心血管科、骨伤科、糖尿病科、银屑病成为国家中医药管理局“十一五”重点专科（专病）建设项目；急诊科被国家中医药管理局批准为“中西医结合急诊临床基地”；骨伤科被卫生部批准成立“（新疆）骨关节基地”；血液科、肛肠科、皮肤科、眼科四个科室成为国家中医药管理局重点学科的协作单位；肾病中心成为自治区中西医结合肾脏病治疗中心。
新疆自治区中医院坚持突出中医药特色、走中西医并重之路。医院汇集了国内疆内有影响的国家名老中医及中青年专家，在中国传统医学与现代医学技术相结合下，医院形成了专科有专家、专家有专病、专病有专药、专方的治疗特色。医院在突出中医特色的同时，根据广大住院患者的病情需要，积极为患者搭建中西医结合的现代化治疗平台，不断增加服务项目，让病情需要的患者足不出疆即可解除病痛的折磨。
近年来，新疆自治区中医院积极开展中西医结合各项临床研究并取得阶段性成果。其中呼吸科的中西医结合治疗慢性阻塞性肺炎和哮喘的临床研究，心血管治疗中心的中西医结合治疗冠心病及心衰的临床研究，骨科的中西医结合治疗膝骨性关节炎及骨病的临床研究、皮肤科的中药治疗银屑病的临床研究等项目。
在开展新技术、新项目的同时，新疆自治区中医院各学科深入挖掘中医文化瑰宝，2008年12月27日成功举办了全疆首届“中医养生文化节（膏方节）”，向全疆各族人民群众普及中医养生文化知识；针灸科开展的“三伏”“三九”贴敷治疗慢支、哮喘已形成规模，取得了良好的社会效益和经济效益；皮肤科用中药药浴治疗顽固性银屑病和带状疱疹，取得良好效果，在疆内外产生较大影响；骨科的中药熏蒸、贴敷治疗骨性关节炎；水疗中心的中药足浴治疗糖尿病末梢神经病变；妇科的中药塌渍治疗盆腔炎项目；眼科以中药和针灸治疗各种眼底病；呼吸科的哮喘和慢性阻塞性肺炎的中医膏方治疗；肝病科的复肝膏贴敷治疗慢性肝炎、脂肪肝、肝硬化项目；推拿科的脊柱调整手法治疗脊源性内科病；针灸科的浮针治疗癌性疼痛以及高血压科的桑梅方均受到患者好评。
新疆自治区中医院现代医学平台建设取得丰硕成果，各学科积极开展新技术新项目。心血管病治疗中心2008年开展心脏介入手术和心脏外科手术1000余例，多项技术达到国内先进水平；骨科中心开展的人工关节置换术、关节镜手术和脊柱外科手术数量已跃居全疆医院之首。
新疆自治区中医院先后荣获“全国文明单位”、“国家中医临床研究基地”、“全国卫生系统先进集体”、“全国卫生系统行风建设先进集体”、“中医药科技管理工作先进集体”、“全国医院文化建设先进集体”、“中医药国际合作基地”等荣誉称号。2008年11月被国家中医药管理局确定为“国家中医临床研究基地”建设单位之一。
新疆自治区中医院多年来以“弘扬一种精神，塑造一种形象，培养一种风气”为主题，号召全院职工把医院的核心价值观、服务理念与全心全意为人民服务统一起来。把患者满意度作为衡量工作的单一标准，要求全体员工在任何时候都要按照“始于顾客之需求，止于顾客之满足”的服务理念为人民群众服务。
