北京三博脑科医院是一家以博医、博教、博研为宗旨创建的学院型医院。始建于2004年，前身是北京三博复兴脑科医院。2006年成为首批卫生部神经外科专科医师培训基地，2007年与天坛、宣武医院组建首都医科大学神经外科学院，成为学院三系。2010年成为首都医科大学第十一临床医学院、首医博士点、硕士点。同时还是北京市首批三级专科民营医院、三级专科医保定点和新农合定点医疗机构，也是中国抗癫痫协会临床实践与培训基地、中国医师协会神经调控专业委员会会长单位。
医院以神经外科为主体，分为癫痫外科、功能神经外科、颅底外科、脑血管病外科、脊髓脊柱外科、幕上肿瘤专业、内镜神经外科、小儿神经外科8个神外亚专业，拥有神经外科6个病区、神经内科2个病区，共设置床位247张，涵盖了功能性疾病、神经肿瘤、脑血管病、脊髓脊柱疾病、小儿颅脑疾病、神经内镜治疗、神经肿瘤化疗、疼痛治疗等神经学科领域。并设神经影像、神经病理、神经眼科、神经电生理室、脑磁图室、神经心理、分子神经病理室及麻醉科、手术室、重症监测治疗室等医疗医技科室。医院总投资过亿，配备了百级净化手术室，层流ICU 。拥有较先进的306通道脑磁图和20套长程视频脑电监测系统、DSA、MRI、CT、术中神经电生理监护仪等高尖端医疗设备。
医院人才荟萃，以一批国内知名的神经外科专家为核心，聚集一大批具有渊博医学知识、丰富临床经验和现代医学理念的医疗精英，形成了各具专业特长、优势互补、结构合理、锐意进取的医疗团队。几年来，累计完成手术过万台，现全面施行显微镜微创技术、神经内镜手术等高端技术，开展了导航手术、立体定向及深部微电极刺激治疗癫痫手术等与国际同步的较新手术方法，进一步提高了手术质量。同时，承担了多项、及省部级科研课题。
2006年，新华社2篇内参《民营也能铸就金字招牌》、《职业在这里真正成了事业》，总结了三博的发展经验，得到了温总理、吴仪副总理充分肯定的重要批示。随后，人民日报刊发了《三博医院调查》，再次全面报道了三博。2010年，中央电视台《新闻联播》报道三博成为首都医科大学第十一临床新闻，这是北京市较早民营医院被正式纳入重点高等院校科研教学体系。
北京三博脑科医院以发展中国的神经科学事业为使命，坚持“技术、品质、服务”的经营理念，优先发展医疗技术，进一步优化学科管理，扩大现有的临床技术及人才优势，构建国际一流的临床、科研、教育基地，打造学院型医院品牌。同时，采用先进的医疗管理模式，并不断持续改进，保护患者的切身利益，用适中的医疗价格和优质高效的医疗服务，满足不同患者的需要，少有限度地回报社会。