简史
万芳医院所地是昔日「万隆」与「芳川」两矿场，「万芳」之名由此而来。 自1989年动工兴建，1996年7月由台北市政府委托台北医学大学筹设经营，于1997年2月15日正式开幕服务市民，为台北市第一家公办民营的市立医院并于1998年2月通过区域医院评鉴，4月荣获市立医院经营绩效评比第一名， 12月通过ISO-9002国际品质认证。 台北市第一家公办民营医院台北市政府为减少每年新台币五亿元的公务预算支出，及借助民间机构经营效率，决定将万芳医院委托民间经营。 历经多次审慎的公告招标，台北市政府同意将台北市第一家公办民营医院委托给台北医学大学经营。 于1996年7月17日正式签订委托经营合约；台北医学大学随即展开万芳医院的筹备工作，于1997年2月15日正式开幕。
台北医学大学与万芳医院
经教育部认定，万芳医院在委托经营期间，视同台北医学大学附属医院。 在地缘上，台北医学大学与文山区是近邻，校本部与万芳医院二者仅距离五公里，附设医院与万芳医院在临床教学研究、人力资源、医疗服务及其他资源之相互支援相当方便。 万芳医院于民国86年起成为台北医学大学医学系及牙医学系见、实习医院；并可提供全校各系、所学生实习及临床研究的教学环境；同时也扩大北医的校友回母校贡献的服务机会。
素描万芳医院
万芳医院位于台北市文山区兴隆路上，与捷运木栅线「万芳医院站」捷运站相连，距离北二高万芳交流道五分钟左右，对外交通便利。 万芳医院为733床的医学中心，建坪约27,000余坪，建筑物分为医疗大楼与宿舍大楼两栋建筑物，医疗大楼地上13层地下3层，屋顶并设有直升机停机坪，地下二、三楼有300余位停车位，停车相当方便﹔宿舍大楼共七层，提供单身医护行政同仁住宿，约可住宿340人。
设置科别及服务特色
万芳医院为医学中心，已经开设有内科系、外科系、妇产科、小儿科、骨科、整型外科、新陈代谢科、血液肿瘤科、泌尿科、耳鼻喉科、皮肤科、眼科、精神科、家庭医学科、牙科、放射肿瘤科、复健科、传统医学科…等42科医疗科别门、急诊作业，为配合民众方便就医，亦提供夜间门诊及例假日门诊服务，台风天亦照常看诊、全年无休﹔病房部份则视实际业务量逐步开放，目前已经开设733床病房。 万芳医院积极网罗各大医学中心及区域级医院的专科医师，组成坚强的医师阵容，设立用药咨询中心、干细胞研究中心、社区医学研究中心、外伤防治中心、疼痛治疗中心、妇瘤防治中心、传统医学科…等，更多具有特色的医疗发展中心将随医师的陆续到来逐渐开办。 文山区各级学校林立，人口及社区结构单纯，为一典型的住宅、文教区，且文山区老年人口所占比率为全台北市之冠，以如此的条件来规划社区卫生工作是非常意义深远的工作。 社区医疗将列为未来发展重点之一，未来将结合台北医学院公共卫生学研究所，对文山区居民做整体的社区健康计画，将发展一社区长期性的纵向式研究及健康维护、促进工作。 台北医学大学希望将万芳医院经营成为一所服务、品质、效率俱优的公办民营社区医疗中心，提供台北市南区及周边地区民众高品质的人性化服务外。