北京中医药大学东直门医院（第一临床医学院）创办于1958年，是国家“211工程”建设的高等中医药院校的附属医院。经过半个多世纪的艰苦创业，几代人的共同努力，医院以其悠久的历史，知名的专家，一流的技术，优质的服务享誉中外，并最早于1991年在欧洲建立中医分院——德国魁茨汀医院，成为重要的中医药国际交流窗口。
目前东直门医院已经发展成为一所集医疗、教学、科研于一体的大型现代化综合性三级甲等中医医院。率先成为全国示范中医院，首批列入北京市医疗保险定点医院；是民政部“明天计划”脑瘫患儿手术康复和“点燃心希望”先心病治疗定点医院；是“国家中医药发展综合改革试验区”建设示范基地和战略合作签约单位、国家名老中医师承教育工作重点建设单位；是国家中医临床研究基地建设单位，拥有教育部重点实验室、国家级中医学实验教学示范中心；是国家食品药品监督管理局认定的国家药物临床试验机构、国家住院医师规范化培训示范基地、国家大学生校外实践教育基地、美国心脏协会心血管急救培训中心、世界卫生组织中医适宜技术项目培训基地、“北京中医药大学临床技能综合培训中心”建设单位和北京中医药大学优秀教学实践基地。
2011年8月，医院与原通州区中医医院整合，通州区中医院正式更名为北京中医药大学东直门医院东区。
医院积淀深厚，名医荟萃，英才辈出，不仅拥有造诣精深、誉名中外的名老中医，也拥有一支经验丰富、技术突出的中年骨干队伍，还有一批基础扎实、勇于进取、脱颖而出的后起之秀，形成了良好的人才梯队。医院先后涌现出了2名中国工程院院士，1名“长江学者”特聘教授和23名享受政府特殊津贴的专家，还有“首都国医名师”3人，“全国五一劳动奖章”获得者1人，“首都十大健康卫士”2人，“首都健康卫士”2人，省部级以上名老中医33人。医院现有国家临床重点专科6个，国家中医药管理局重点专科16个，北京市重点专科（北京市特色诊疗中心）11个；教育部重点学科1个，国家中医药管理局重点学科9个，北京市重点学科2个；全国名老中医药专家传承工作室16个，北京中医药“薪火传承3+3”工程“二室一站”14个；教育部创新团队1个。
医院现有一院两区（本部和东区）及东城区台基厂3号和东城区东四北大街279号国际部、中石油门诊部多个执业地点。目前开放床位1574张，设置临床科室32个。本部共有职工1306人，其中医生457人,护士500人，医技97人，行政后勤176人；正高120人，副高167人，中级351；博士170人，硕士202人。东区职工855人，其中医生286人，护士267人，医技125人，行政62人；正高23人，副高57人，中级165人；博士23人，硕士147人。年门急诊量达300万人次，收治住院病人近3万人次。
建院以来，医院以雄厚的师资队伍、优异的教学业绩、丰富的教学经验承担着北京中医药大学中医学本科生、硕士生、博士生以及台港澳班、留学生的临床授课和实习任务。1958年至今，培养了数以万计的高质量、高水平中医医师，为世界各地输送了大批优秀的中医专业技术人才。现有一级学科博士学位授予点2个，涵盖6个博士学位授权学科点，7个硕士学位授权点。共有博士研究生导师35名，硕士研究生导师111名, 北京市教学名师及优秀教师4名，主编教材数十部。
医院不断提升科研能力和平台建设，现为国家中医临床研究基地建设单位，拥有教育部中医内科学重点实验室1个，北京市中医内科学重点实验室1个和国家中医药管理局三级实验室2个，国家中医药管理局重点研究室3个，校属III类研究机构2个，校属I类研究机构14个。“十二五”期间，共承担国家级课题73项，省部级课题135项，共获得科研经费1.63亿元；医院共获得各级各类科技奖励26项，其中国家级奖励2项，省部级奖励16项。获得相关专利20项，发表SCI论文90篇，出版专著94部。2014、2015连续两年在中国医院科技影响力排名中列居中医院排名首位。科研带动了临床及教学的发展，医院的综合实力迈上新的台阶。
医院重视品牌建设，不断探索公立医院改革新模式。探索实施了十种模式（德国模式、通州模式、普通社区模式、功能社区模式、鼓楼模式、国际医疗部模式、医联体模式、昌平模式、涿州模式、战略联盟）积极发挥三级甲等医院辐射作用，成立了中医院战略联盟。目前已形成以东直门医院为核心、辐射全国21个省份136家(截止2015年)，中医医院的医疗联盟，开展了包括人才培养、传承、医院诊断、科学研究、学科专科建设、医疗会诊及转诊、教学合作、专项活动在内的8种合作方式，全面提高了基层中医院服务能力，扩大了医院的社会知名度和行业知名度。
本固枝愈荣，杏苑舞芳菲。北京中医药大学东直门医院根植首都北京，心怀九州寰宇，借助医疗体制改革和中医药大发展的春风， 践行“求是善行”院训，秉承“患者第一，服务第一”办院宗旨，继续全面实施“特色立院、人才强院、科技兴院、文化塑院”的战略方针，坚持医、教、研协同发展，追求管理一流，服务一流、技术一流，凸显中医特色优势，推动行业学术发展，努力将医院建成开放型、研究型、国际化、全国首善的中医医院。同时，期待与越来越多的业内同仁和各界朋友们加强交流、精诚合作，为中医药事业和人类健康共奏华章！