泉州市儿童医院创建于1990年元月，前身是一所侨建公办的儿童医院，1997年加挂“泉州市妇幼保健院”牌子，目前实行“一套班子，两块牌子、医疗保健两院合一”的管理模式。院区占地面积36000平方米，建筑面积42000平方米。编制病床350张，员工480人。其中享受国务院特殊津贴专家3人，留美博士1人，硕士11人。高级职称55人，中级职称65人。设NICU、PICU、新生儿、神经康复、肾脏血液、哮喘、小儿心血管中心、眼科、妇科、产科和VIP等十二个专业病区和相应的专科门诊。是“省新生儿疾病筛查中心泉州分中心”和“省新生儿救护中心泉州分中心”的所在医院。
近年来，泉州市儿童医院坚持以市场为导向，走临床与保健机构结合的道路，业务建设超常规发展，连续十年年均经济增长超过30％。十五年来，全院在国家、省级刊物发表学术论文900篇，16个课题21次荣获省、市、厅级科技进步奖，硕果累累，成绩斐然。