南京大学医院成立于1978年，1996年9月评定为“一级甲等医院”。1998年11月被批准为“第一批对社会开放的职工医院”。2003年成立了“南京大学医院浦口分院”。2004年9月被批准为“南京大学社区卫生服务中心”。
南京大学医院（中心）建筑面积 5495 m2（其中浦口分院建筑面积2695 m2），辅助用房538 m2，设置病床87张（其中浦口分院27张），设有内科、外科、皮肤科、妇科、口腔科、五官科、理疗科、推拿科、放射科、胃镜室、心电B超室等业务科室19个。配置有500mA东芝X光摄片仪、荷兰威图全自动生化分析仪、全自动血球计数仪、血液流变仪、德国超霸B超、日本奥林巴斯透视胃镜、全自动心电分析仪、心电监护仪、动态心电动态血压监测仪、低周波及电脑中频仪等较先进的医疗仪器设备。
南京大学医院（中心）环境整洁，服务规范，始终“以病人为中心，以信誉为生命，以质量为重点，以内涵为根本”。医院（中心）有在编职工80人，其中正高职称1人，副高职称13人，中级职称42人, 4人具有高等学校教师资格。主要承担师生员工和南秀村、陶谷新村、青岛路社委会居民的医疗保健服务任务。
24小时提供全科医疗、院前急救、出诊服务。开展门诊、住院、家庭病床、日间病房服务，开展健康体检、健康教育、康复治疗、康复指导、免疫接种、计划生育指导、妇女保健、儿童保健、老年保健、社区咨询、巡诊等服务。
可为社区65周岁以上老年人群、残疾人、精神病患者及高血压、糖尿病等慢病患者建立健康档案。外聘省人民医院、鼓楼医院4名专家常年开设心脏科、内分泌科、神经内科、呼吸科等专家门诊，与上级医院建立双向转诊制度，全方位地为广大师生员工、社区居民提供方便、优质、价廉的卫生保健服务。
1996年9月评定为“一级甲等医院”。1998年11月被批准为“第一批对社会开放的职工医院”。2003年成立了“南京大学医院浦口分院”。2004年9月被批准为“南京大学社区卫生服务中心”。
优质的服务受到病人的欢迎和好评，曾被教育部、国家体育总局评为“全国高校体育卫生先进单位”，被江苏省教育委员会评为“江苏省高等学校后勤系统先进集体”及“《学校卫生工作条例》评估检查个性单位”，多次被南京市卫生局、南京市健康教育协会评为“健康教育工作先进单位”、“健康教育工作第一名”，在SARS防治工作中受到省委、省政府、区政府的表彰。