孙吴县人民医院创建于1945年，至今已有60多个年头。经过老一辈卫生工作者的共同努力，取得了很大的进步。县医院全院职工161人，其中业务人员134人，临时工31人，退休职工60人，具有高级职称人员27人、中级职称人员77人，具有大学学历的22人。拥有CT、彩超、B超、血流变、拍片、透视机等200余台件。
孙吴县人民医院为二级乙等综合医院，是孙吴县境内的单一的综合医院。承担着辖区内10万人口和周边农场的医疗、预防、科研、教学任务。帮助辖区卫生院所培养卫生技术人才提高农村卫生初级保健工作。医院拥有编制床位114张，每年门诊量65000人次，住院病人2600人次，手术1800例，其中大型高难手术占20%，同时承担着突发事件、应对大型传染病和急诊急救的任务，每年抢救急难危重病人100于人次，抢救成功率均在90%以上。多年来医院工作人员克服了条件差设施落后的不利因素，用吃苦耐劳，高度敬业的职业精神为一方平安和人民群众的身体健康做出了突出的贡献。
疾病预防控制中心，现有职工30人。内设11个科室：综合办公室、传染病预防控制科、地方病慢病非传染性疾病预防控制科、检验科、计划免疫科、健康教育科、质量管理信息情报科、食品营养安全检测科、环境卫生安全检测科、劳动卫生科、结核科。
主要负责： 1、传染病防治。2、卫生防疫工作。3、计划免疫工作。4、地方病工作。5、结核病防治工作。
县卫生监督所，是隶属于卫生局的卫生监督执法机构，卫生监督所编制15人，现有职工14人。内设科室8个，卫生法规宣传稽查科；证照管理科、（预防性卫生监督科）；医政卫生监督科；食品卫生监督科；公共卫生监督科、（学校卫生监督科、母婴保健监督科）；传染病监督科；放射卫生、职业卫生监督科。