南京医科大学第三附属医院（省属红十字医院，爱婴医院），是集医疗，教学，科研，预防，保健为一体的综合性医疗机构。医院为国家二级甲等医院，是仪化职工医保和仪征市医保定点医疗机构。承担仪化公司职工家属和周边群众的医疗保健及工业卫生等任务。现开设床位310张，有职工399人，其中中高级卫技人员200多人。该院和省各大医院合作，特邀省级专家定期来院坐诊。
南京医科大学第三附属医院专科力量雄厚，技术优势明显，骨科，儿科为扬州市重点专科。“窥镜，腔镜，介入”三大微创技术是扬州地区实力突出，影响面广的强项专科。近年来，相继引进开展了新技术，新项目168项，部分技术项目达到了三级医院的技术水平，填补了县市级地区的技术空白。
南京医科大学第三附属医院注重高新科技在医院发展中的重要地位和作用，利用南京医科大学良好的科研条件与各兄弟单位加强科技协作，近5年来，医院立项并实施课题62项，其中获省市级奖项多次，医院医护人员发表论文685篇，其中在省级以上刊物发表455篇。
南京医科大学第三附属医院现承担南京医科大学预防医学专业学生的8门临床理论课共420学时的教学任务，同时又接受了武汉科技大学医学院等中专，高校的实习教学任务，每年在院学习的学生120多人。