良性畸胎瘤切除彻底，手术经过顺利，一般无复发，长期随诊预后良好。恶性畸胎瘤治疗的效果均不满意，我国国内一组报告，3例恶性畸胎瘤分别于切除后1个月，半年和1年复发死亡。我院胸外科手术治疗畸胎瘤中，曾发现4例畸胎瘤恶性变，其中2例于术后2年内死亡。
1例为15岁男孩因纵隔畸胎瘤切除后1年复发入院，再次手术时未能彻底切除。 次年肿瘤广泛侵犯纵隔脏器和肺，致呼吸循环衰竭死亡。尸检报告为“纵隔畸胎瘤恶变腺鳞癌”。
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