维吾尔医学是中华民族传统医学宝库中的瑰宝，具有2000多年的光辉历史和完整的理论基础。新疆维吾尔自治区维吾尔医医院是全疆单一一所自治区级综合性维吾尔医医院。
经上级有关部门评审于2000年10月达到全国中医（民族医）示范医院标准，有较雄厚的技术实力，著名维吾尔医专家坐诊。设有急诊科、内科、普外科、骨科、肛肠科、皮肤科、妇产科、理疗科、检验科、放射科、功能检查科、药剂科、手术麻醉科、制剂中心等科室。
遵循维吾尔医独特传统理论和诊疗技术，新疆维吾尔自治区维吾尔医医院在治疗各种疑难杂症、慢性病方面有显著疗效，尤其是对白癜风、牛皮癣、顽固性湿疹、骨创伤、糖尿病、支气管哮喘、心血管疾病、消化道疾病、功能性子宫出血、男女不孕症、男性病等疗效显著。
治疗上主要根据患者不同分型、分期，辩证运用维吾尔药同时配合维吾尔医特色疗法日光浴、涂油、按摩、药浴、食疗等理疗方法辩证施治。维吾尔药主要采用植物、动物、矿物和果品等天然药材精制而成，具有疗效确切、无毒副作用的特点，已有87种维吾尔药列入国家部颁布标准。在当代社会回归自然热潮中独树一帜。