南京军区福州总医院（原九三医院）又称东方医院，建于1949年8月，是一家具有光荣历史的医院。经过半个多世纪的建设和发展，已成为学科齐全，技术力量雄厚，设备先进，诊疗环境优良，集预防、医疗、保健、教学、科研为一体的大型综合性"三级甲等医院"。医院是国家卫生部国际紧急救援网络医院、福建省"120"医疗急救网络医院、省交通事故救治定点单位以及省、市医保首批定点医疗机构。
医院由院本部、莆田九五临床部、宁德442临床部、福州476临床部组成。医院院本部位于福州市西侧，毗邻西湖、左海公园，交通便捷，依山傍水、绿树成荫、空气新鲜、鸟语花香，是全军"文明卫生营院"和"园林式营院"以及福建省"福建省花园式单位"、"福建省卫生先进单位"、“福建省绿化环保先进单位”。医院院本部占地面积38万平方米（570亩），医疗用房面积10多万平方米。新建的门诊大楼是国内一流的门诊大楼。大楼被评为全军优质工程，总面积2.7万平方米，楼高20层，是一栋集智能化、信息化、网络化、人性化的大楼。大楼安装有中央冷暖空调，主楼设有四部垂直电梯，裙楼设有自动扶梯。医院病房整洁、宽敞、明亮，设有中央空调、中心急救设施和双向通话系统。规划中的新病房楼由五栋大楼组成，建筑面积近10万平方米，建成后将极大地改善医院的就医环境。
医院现展开床位1900张，其中院本部展开1300张。医院年门诊量达近100万人次、年住院量4万余人次，年手术量2万多台次。医院技术力量雄厚，拥有高级技术职称专家近300名，具有博士、硕士学位者200多名，在国家、军队及省级担任学术职务320多人次。其中领军人才3人，全军级学科带头人9人，军区级、省级学科带头人40多人。
医院院本部设有53个专业学科。拥有1个国家级重点学科：国家中医药管理局肿瘤重点学科；7个全军级重点学科：全军临床检验医学研究所、全军器官移植中心、全军儿科疾病诊治中心、全军计划生育优生优育研究所、全军临床药理基地、全军医院信息化研究与技术支持基地、全军卫生音像制作中心；12个南京军区重点学科：军区普通外科研究所、肝胆外科研究所、骨科研究所、妇产科研究所、呼吸内科中心、消化内科中心、肾脏病中心、神经外科中心、肿瘤中心、中医中心、药学中心、病理诊断中心。去年以来，为加强学科建设力度，医院党委提出了内外科联合建设、技术相似性学科联合建设的思路，即学科群的建设概念，在全军器官移植中心学科群组建成功的基础上，已先后又组建了普外消化学科群、肝胆内外科学科群、骨科学科群、神经内外科学科群、医学影像中心学科群，丰富了医院学科建设内涵，已取得初步成效，使医院学科建设迈向了新台阶。
器官移植是医院的主要特色，已先后开展肾脏、肝脏、肝-胰-肾、肝-肾、胰-肾、心脏、心肺、肺脏、角膜、骨髓等移植，手术的种类、数量和质量居国内领先水平，成为国内重要的大型器官移植中心之一。同时，医院在肾脏病、肝胆疾病、女性尿失禁、脊柱疾病、颅脑疾病、老年病、心脑血管病、消化病、肿瘤等疾病诊治方面处于国内先进水平。医院开展的临床检验技术、血液净化技术、放射介入技术、病理诊断技术、微创技术、超声诊治技术等处于军内外、省内外先进水平。
医院设有国家人事部博士后科研工作站，拥有7个博士后带教学科。医院是第二军医大学、南方医科大学、福建医科大学临床医学院、第四军医大学教学医院、第四军医大学口腔医学院教学医院。有23个学科（专业）点与上述高校及福建中医学院联合培养博士、硕士研究生，拥有博士、硕士研究生导师61名。此外，医院每年还承担上述高校及其它高校近400名本科生临床大课、临床见习、临床实习教学任务，每年接收军内外进修生200余人次。
医院科研能力较强、研究水平较高。目前，医院承担了国家、军队和福建省科研项目60多项，其中重大项目近10项，还承担了100余项院内科研项目。多个研究项目有望取得重大突破。"十五"以来，医院获国家、军队科技进步、医疗成果奖和福建省科学技术奖113项，其中国家科技进步二等奖2项，军队医疗成果一等奖1项、军队科技、医疗成果二等奖5项，福建省科学技术一等奖1项、二等奖13项。在国内外期刊上发表学术论文3000余篇，出版专著20多部。
医院重视科学化管理工作，1998年以来，医院建立了以信息技术开发和推广应用为主要内容的国家金卫工程"军字一号"，有25台服务器、1500多个计算机工作站联网并正常运行，使全院日常医疗、护理、教学、办公实现数字化。各类信息系统，如医院信息系统（HIS）、医学图像传输与存贮系统（PACS）、临床检验信息系统（LIS）、麻醉信息系统、心电监护系统、心电图信息系统、办公自动化系统（OA）均实现无缝联接，初步建成数字化医院。2005年，医院被评为全军五家数字化医院试点单位之一，今年已申请成为全国十家数字化医院试点单位之一，有望取得成功。
医院重视全面建设，坚持正确的办院方针，树立"以病人为中心"的服务理念，坚持为部队服务方向，将"团结、奋进、德高、技精"作为院训，以质量效率为基础、科技为先导，大胆改革、开拓创新，严格执行医疗护理等各项规章制度，不断完善质量管理体系，极大地促进了医疗护理服务质量的提高。医院注重医德医风建设，开展了让病人"方便、放心、满意"等活动，并全面实施整体护理与健康教育工作，不断拓宽服务项目、深化服务内涵，密切了医患、护患关系，涌现了一批"军中白求恩--温端生"式的白衣战士，他们以精湛的技术、优良的服务，热忱为国内外来院就诊人员服务，获得了广泛赞誉。医院已连续三次六年被评为全军为部队服务先进医院。2006年，被总政、总后联合表彰为全军先进医院。
今后，医院将按照科学发展观的要求，加强学科、人才、技术建设，不断提高科学化管理水平、不断提高医疗护理质量，以最精湛的技术、最优质的服务、最大的诚意为广大患者服务，为推动我国医疗卫生水平的提高、促进人类健康、促进社会进步作出自己更大贡献。
医院拥有国内领先的医疗、教学、科研设备，设备总值已超过5亿元，主要有PET-CT、磁共振仪2台、双螺旋高速CT2台、全身γ-刀、ECT、DSA、数字胃肠机（DR）、数字拍片机（CR）、头颅X-刀、直线加速器、流式细胞仪、电子显微镜、大型彩色多普勒仪、电子胃肠镜、自动麻醉机、体外震波碎石机、高压氧舱群、全层流净化手术室等。
医院承担了国家、军队和福建省科研项目60多项，其中重大项目近10项，还承担了100余项院内科研项目。多个研究项目有望取得重大突破。"十五"以来，医院获国家、军队科技进步、医疗成果奖和福建省科学技术奖113项，其中国家科技进步二等奖2项，军队医疗成果一等奖1项、军队科技、医疗成果二等奖5项，福建省科学技术一等奖1项、二等奖13项。在国内外期刊上发表学术论文3000余篇，出版专著20多部。
医院已连续三次六年被评为全军为部队服务先进医院。2006年，被总政、总后联合表彰为全军先进医院。