上海仁济医院建于1844年，是上海开埠后第一所西医医院，迄今已有164年的历史。164年来，医院的规模不断扩大，尤其是建国五十多年来，医院得到了迅速地发展，成为学科门类齐全，集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院。医院由东西二部组成。西部位于上海市黄浦区中央商务区内，毗邻外滩；东部位于浦东陆家嘴金融贸易区内。医院占地面积145亩（东院131亩、西院14.1亩）；建筑面积：185744m2（东院147443.9m2、西院38299.8m2）；核定床位1300张（东院1000张、西院300张）；实际开放床位1600余张。目前全院在编人员2651人，卫技人员2196人。医院医疗技术力量雄厚，目前拥有在职正高职称专家122名，副高职称专家289名，据较新统计资料，年收治门急诊病员近217万余人次，住院病人逾 5万7千人次，完成各类手术2.8万余台。目前医院拥有立体定向下微电极刺激仪（细胞刀）、超声刀、核磁共振仪（MRI）、多层螺旋CT（MSCT）、数字X线摄片机（DR）、PET-CT、肿瘤放疗设备、数字减影心血管造影系统（DSA）、单光子发射计算机断层检查仪（SPECT）、彩色Doppler诊断仪、流式细胞仪、大型生化分析仪等先进的大型医疗设备。
新中国成立以来，上海仁济医院取得了许多临床医学成果，填补了我国医学的多项空白，如心脏二尖瓣狭窄分离术，使心脏手术从心外进入心内禁区；低温麻醉下心内直视肺动脉瓣切开术，是我国心内直视技术的开端；低温麻醉房间隔缺损直视修补，则使低温直视心内手术上了新台阶；针刺麻醉下体外循环心内直视手术成功，更是我国的开创性医学成果。江绍基教授因“消化疾病和血吸虫病等领域”的卓越成就，获得中国工程院院士称号。此外，国内首次成功施行的皮肾静脉吻合术、门腔静脉吻合分流术、晚期吸血虫病外科治疗、脾血回输新技术等，都具有相当高的水平。
上海仁济医院自上个世纪九十年代起，在上海市人民政府、市卫生局和浦东新区政府的决策与社会各界的大力支持下，仁济医院的发展借助浦东全面开发开放的东风实现了历史性的飞跃。1999年10月，仁济东院建成投入使用，摆脱了长期困扰医院发展的地域限制，医院占地面积由原来的14亩扩大为145亩。床位数由原来的800张增加到1300张。目前，东部进入三期建设快速发展时期：2007年底干部保健综合楼实现结构封顶。建筑面积5.85万平方米的门急诊医技楼经上海市发改委正式批准立项。
上海仁济医院在学科建设和人才培养方面都取得了显著的成效，不少学科在国内已有较高的知名度。目前医院共设临床科室33个，临床医技科室8个，并有国家教育部重点学科、卫生部重点实验室1个（消化内科）、国家教育部重点学科组成单位1个（内科学）；国家教育部重点学科培育学科组成单位1个（神经外科学）；十五“211工程”重点学科（专业）3个（消化内科学、风湿病学、外科学）；上海市重点学科2个（消化疾病学、风湿病学）；上海市教委重点学科2个（风湿病学、妇产科学）；上海市临床医学中心2个（消化疾病、风湿疾病）；上海市医疗质控中心3个（血透、消化内科、激光）；市级研究所3个（消化疾病、风湿疾病、男性疾病）；上海市单一的人类精子库、上海市产科心脏病监护中心、上海市危重孕产妇会诊抢救中心。目前我院有副主任委员5名；上海市主任委员4名、副主任委员10名；刊物主编1名、副主编9名；地方刊物主编4名、副主编20名。
近5年来，上海仁济医院申请到局级以上（含局级）科研项目296余项，申请专利72项，在全国医疗机构中名列前茅。在国际交流方面，医院已与美国、法国、日本等近十个国家的二十多所医学院校建立了学术交流和友好合作关系。每年接待来访及讲学的外宾千余人次，派往国外留学、讲学和合作科研人员百余人次。医院在人才培养方面也大力投入，努力推荐个性中青年骨干进入各级培养计划，五年中仁济医院共有160余人次入围上海市各级人才培养计划，包括长江特聘教授、上海市领军人才、科委启明星、科委启明星后、教委曙光计划、市教委优青、交大医学院优青、交大医学院百人计划等。
上海仁济医院设有18个教研室承担临床教学任务，博士学位授予点13个，硕士学位授予点21个，博士研究生导师30名，硕士研究生导师98名，数十年来为国家培养了5000余名医学人才。
2001年，上海仁济医院在全市三级综合性医院中率先推行并通过ISO9001质量管理认证体系，并每年通过质量认证，使仁济医院的质量管理上了一个新的台阶。医院积极探索集团化管理，三家分院（嘉定区中心医院、崇明区中心医院、长宁区同仁医院）由仁济医院直接托管。与社会合作的仁济医疗管理公司，通过市场化运作，以品牌效应领先，以集团规模制胜，把个性的医院管理模式加以推广、传播。目前，公司已成功托管十二家医院。涉外全康国际医疗中心为驻沪外籍人士提供具有质量和诚信的医疗保障。
上海仁济医院倡导诚信服务。近三年在上海市万人问卷调查中病人满意率处于全市前列。曾荣获全国卫生系统先进集体称号，连续九次获上海市卫文明单位称号。