广西壮族自治区妇幼保健院始建于1963年3月。2002年10月增挂广西壮族自治区儿童医院牌子。2006年12月，新建广西妇女儿童医院。经过几十年的建设，该院已经发展成为集保健、医疗、科研、教学为一体的三级甲等妇幼保健院、国家级爱婴医院及联合国儿童基金会与卫生部合作项目妇幼师资培训中心。
医院占地15310平方米，建筑面积21353平方米。开放床位340张。2008年在职职工918人，其中卫生技术人员740人，具有正高级技术职称12人，副高级技术职称59人，中级技术职称273人，享受政府特殊津贴专家1人。2008年门急诊量603756人次，住院量18953人次，全年业务收入13883万元。全院固定资产8842万元，拥有彩色多谱勒诊断仪、人工心肺机等万元以上医疗仪器450台。2006年12月自治区发改委下文《广西壮族自治区发展改革委员会关于广西妇女儿童医院项目建议书的批复》（桂发改社会[2006年]832号），同意以自治区妇幼保健院为基础，在南宁市厢竹路广西卫生科技园小区新建广西妇女儿童医院项目，项目建设规模按500张病床规模设计，总建筑面积45000平方米，该项目同时被列为自治区成立50周年大庆重大公益建设项目，该项目预计2009年底完工。
妇产科和儿科是该院的特色专科，其中妇产科是广西重点建设学科之一，设妇科、产科、生殖健康科、生殖中心和优生遗传科；儿科设新生儿重症监护室和儿童重症监护室、新生儿科、儿科、小儿外科。
医院成立以来，完成科研课题138项，获各种级别奖励25项，其中《广西出生缺陷研究（59所医院）》获国家科学技术进步三等奖。医院先后获“中国优生优育先进集体奖”、“全国精神文明建设工作先进单位”、“广西壮族自治区文明单位”等荣誉称号。
拥有价值4000余万元的原装进口三维彩色多普勒超声诊断仪、黑白多普勒超声诊断仪、全自动生化分析仪、显微操作系统、程序冷冻系统、卵泡发育监测系统、X光机、乳腺钼钯X光机、口腔全景X光机、腹腔镜、宫腔镜、阴道镜、呼吸机、监护仪等先进的医疗设备。