上海传染病医院创建于1914年，是上海市卫生局直属的市级专科医院和上海市疾病控制中心的临床基地，也是上海铁道大学医学院的教学医院和卫生部全国传染病医师培训基地，1995年被评为三级甲等医院，连续15年被评为局、市、部文明单位。
上海市传染病医院占地面积29880m2，核定床位400张，职工660余人，其中高级职称32名。上海市传染病医院设有7个临床科室、10个病区及检验科、影像诊断科等辅助科室。拥有螺旋式CT、彩色多普勒超声诊断仪、血透仪、定量PCR检测仪、800mA X光机、高效液相色谱仪、全自动生化分析仪、电子胃镜、电子结肠镜和腹腔镜等大型先进医疗设备。
上海市传染病医院主要收治各型病毒性肝炎、妊娠肝炎、重症肝炎、活动性肝硬化、伤寒、乙型脑炎、流行性出血热、流行性脑脊髓膜炎、化脓性及结核性脑膜炎、肠道传染病、艾滋病、破伤风、狂犬病、性病等法定传染病。
对治疗慢性肝炎、重症肝炎、孕妇肝炎和结核性脑膜炎等均有特色，抢救成功率高；对重症乙脑呼吸衰竭及出血热肾功能衰竭和各种肠道传染病的抢救治疗均有丰富的经验，抢救存活率达到国内领先水平。