深圳百合医院是集医疗、科研、教学、公益、预防、保健服务为一体以妇科产科为特色的现代化大型综合医院,，是大连医科大学教学医院、社会医疗保险定点医院、劳务工合作医疗定点医院。
深圳百合医院开设有妇科、产科、儿科、神经外科(脑外科)、骨外科、泌尿外科(男科)、神经内科、心内科、呼吸内科、结石科、肛肠科、耳鼻喉科、皮肤病科、胃肠科、中医科、康复科等20多个综合科室。同时配备了完善的医疗附属科室，如急诊科、产科中心、医学影像中心、医学检验中心、微创手术中心、120急救中心、健康管理中心、学术交流中心、网络远程会诊中心、患者服务中心、疾病普查中心、免费救治公益行动基金。
深圳百合医院坚持科技兴院的方针，巨资引进大批高尖医疗设备，拥有00肛肠检查治疗系统、结肠水疗仪、手术显微镜、以色列爱情2号激光美容工作站、美国威视VISX STRA S4准分子激光视力矫治系统、德国WOLF电子鼻内窥镜、美国BEYOND牙齿冷光美白仪、豪华型强力靶向治疗仪、奥林巴斯电子胃肠镜、美国史赛克腹腔镜、膀胱镜、宫腔镜、全数码电子阴道镜、前列腺射频治疗仪、前列腺微波治疗仪、全自动精子分析仪、实施三维彩色超声检查仪、腔内B超、红外线乳透检测仪、腰椎牵引床。并有国际标准的层流净化手术室。
医院秉承“高起点、创一流”的办院理念，从北京、上海、黑龙江、武汉等地一批知名专家、教授、经验丰富的主任医师坐诊，针对患者病情制定个性化的诊疗方案，形成了完备的中西医结合治疗体系。
深圳百合医院一直以提升广大市民的健康质量为已任，构筑了患者至上、医德至尚、医技至精、服务至诚的办院理念。服务社区，惠利于民，立足布吉辐射全深圳，成为深圳家喻户晓的放心品牌。
2008年，在深圳市卫生局医疗服务质量整体评估中，获得社会办医院深圳市第三名、龙岗区第一名的优异成绩，成为深圳市十家A级医院 之一;2009年，百合医院成为港澳台同胞定点医疗合作医院;2008年，百合医院成为深圳首批健康体检服务认证医疗机构;2011年成为受欢迎、具有影响力品牌医院。