东莞地铁一共规划了6条轨道线路途经32个镇区，最新规划中保留原《东莞市轨道建设规划》中城市轨道1号线、2号线、3号线的线位方案，优化调整4号线线位，增加4号线支线，衔接深圳城市轨道4号线，远期预留增加5号线、6号线。城市轨道交通线路总长307.8公里，共设置车站84座，其中城市轨道间换乘枢纽车站8座，途经32个镇区。
  东莞地铁1号线：以麻涌西站为起点，途经广麻公路、望沙路、水乡大道、万江大道、鸿福路、八一路、莞长路（G107）、建设路、新城大道、松佛路、富民大道、公常路至黄江南站。
  东莞地铁2号线：北起东莞火车站，向西途经莞龙路、东城中路、东莞大道、莞太路、连升路止于长安新区东站。（2015年底试运行）
  东莞地铁3号线：西南起于长安新区南站，途经新沙西路、靖海中路、S358、新城大道、常平北环路、口岸大道、常东路、大东路、东平大道，止于企石博夏站。
  东莞地铁4号线：线路始于1号线黄江中心站，经清龙路、塘龙路、清塘路、清凤路、鹿湖路、东风路，止于清溪东站。
  东莞地铁5号线：北起于石龙站，向南途经龙升路、月湖路、东园大道、企石环城大道、振华路、东山大道、20号公路，止于谢岗站。
  东莞地铁6号线：北起于石排北站，经长青南路、德政中路、莞长路（G107）、新城大道、西环路、创业路、樟木头大道、香芒路、聚富路、清凤路、东深路、止于凤岗南站。