牡丹江市肿瘤医院始建于1962年，1980年成立牡丹江市结核病防治所后实行院所合一，1990年11有经省卫生厅批准，在保留结核病防治院原有功能的基础上成立了牡丹江市肿瘤医院，1998年经市编委批准将市肿瘤防治所并至肿瘤医院，1998年11月牡丹江市放射治疗中心挂牌成立。医院现实行“一套班子、两个专业、四位一体、防治结合”的管理体制，承担着牡丹江地区结核、肿瘤疾病的医疗、预防、教学、科研和培训任务，是黑龙江省东南部地区单一一家独具特色的专科医院。
牡丹江市结核、肿瘤医院位于爱民区康佳街101号，占地面积19900平方米，建筑面积13466.2平方米。医院现开设床位300张，设有头颈外科、乳腺外科、胸外科、骨软科、腹外科、妇瘤科、泌尿外科、介入科、放射治疗中心、化疗科、结核内科、康复科、家床科、儿科、体检科、门诊部等临床科室，药剂科、检验科、放射线科、CT室、ECT室、B超室、腔镜室、病理科、麻醉科等医技科室及会诊中心。医院年门诊量45000余人次，年收治住院病人3000余人次，年手术1500余人次。
牡丹江市肿瘤医院现有专业技术人员312人，其中副高职以上人员56名，中级专业技术人员160名。1991年以来，医院先后与天津肿瘤医院和中国医学科学院肿瘤医院实行技术协作，大力培养和引进技术人才。经过十余年的努力，培养出了一批业务精湛的临床专家，如肿瘤专家郭冰、张敬义、刘满中、刘本烈、孙晓峰、林青、李文等，结核专家刘玉珍、吕万凤、马力、杜鹏、孙福仁、蓝裕奎等在市内及周围市县均享有很高的知名度。近几年来，医院开展的各种肿瘤的高难度根治手术，肿瘤的化疗、放射治疗、介入治疗，结核病的化学治疗及综合治疗等，在市内同行业同科系中均处于领先地位，其中填补省内空白3项、填补市内空白77项。十余年来，医院依靠科技兴院，走内涵发展的道路，采取多种形式的继续教育，提高医务人员的政治素质和业务素质，目前已形成高、中、初级梯队配备合理的专业技术队伍，并在医疗、科研工作中取得可喜成绩。1991年以来，医院共获得省医药科技进步三等奖2项，市科技进步二、三、四等奖计18项，省、市级科技成果奖38项，医疗新技术奖89项。刊物发表文章107篇，省级刊物发表文章127篇，国际交流论文6篇，大会交流论文196篇，省级交流论文235篇。
牡丹江市肿瘤医院拥有现代化医疗设备2300余万元，其中有美国ispeed CT、Millennium ECT、模拟定位治疗机，上海产医用直线加速器，山东产新华钴 机、遥控后装治疗机，日本产阿洛卡1800型彩色B超、1400型B超、800MA遥控X光诊断机，奥林帕氏纤维腔镜显象系统，乳腺X光机，冰冻切片机，全自动生化分析仪、微生物鉴定及药敏系统等大中型医疗诊断设备90余台件，为诊断、治疗的高效、准确提供了保证。是牡丹江市结核、肿瘤疾病诊断设备最齐全的医院。
牡丹江市肿瘤医院坚持深化内部改革，织经管理，积极探索加快医院发展的路子。在人事制度方面实行全员聘任制；在职称聘任方面实行评聘分开，竞争上岗；在分配制度方面按照“多劳多得”、绩效持钩、成本核算的原则进行分配；在管理体制方面推行院科两级负责制；在科学管理管理方面把计算机网络化作为实现医院管理现代化、规范化的一种重要手段，全院实现了从财务到门诊划价、收款、取药，从病案到药库，从临床科室到住院处等信息网络化管理并建立了一套比较完整的规章制度和质量保证体系。从而增强了全院职工的医疗质量观念和医疗安全意识，使医院整服务水平上了一个新台阶。
牡丹江市肿瘤医院党政领导班子坚持“两个文明”一起抓，始终把“以病人为中心”作为办院宗旨。狠抓职业道德建设、树立了自觉抵制和纠正行业不正之风的思想和无私奉献精神。几年来，坚持开展优质服务竞赛和“塑形工程”等文明单位创建活动，并在2000年初开展了以“医疗价格、服务作风、医疗质量、就医环境”为主要内容的“满意工程”活动，“不让一个不满意的患者离开自己的岗位”已成为全院职工工作的准则。通过设立举报电话、举报箱、院长接待日、签定双向承诺书及聘请社会监督员，实行药品采购公开招标、病人选择医护人员、一日清单等一系列外部监督措施等，使医院取得良好的社会信誉和经济效益。近几年来，经市卫生局对门诊、住院、出院病人随机抽样调查，综合满意率在98％以上。
牡丹江市肿瘤医院曾先后获得市级文明单位标兵、市先进党委、省极佳服务信得过医院、市青年文明号、局级示范窗口优胜单位、局目标管理优胜单位、市计量工作先进单位、市公安保卫工作标兵单位、省文明单位、省五四红旗团委创建单位、市先进单位、市党风廉政先进集体、市文教系统“学、比、树、创”先进集体等项光荣称号。党委书记、院长郭冰同志被评为省劳动模范、市个性共产党员标兵。
在新的世纪里，结核、肿瘤医院的全体职工将以极佳的服务态度，最精湛的医术，较先进的设备，较高尚的医德，最合理的价格，为广大患者提供最优质的服务。