首都医科大学附属北京口腔医院创建于1945年，是集医疗、教学、科研、预防为一体的三级甲等口腔专科医院。医院分为天坛部和王府井部，天坛部位于古老的天坛公园西南侧，王府井部位于北京市王府井中心商业区的锡拉胡同，环境优美，设施齐全。
70余年的发展历程中，医院遵循“严、精、勤、谨”的院训，坚持严谨的科学态度，追求精湛的医疗技术，全心全意为广大患者解除各种口腔疾病的困扰，营造舒适和谐的就医氛围，获得双十佳人民满意医院、首都文明单位等称号。
医院总占地面积23000平方米，建筑面积33312平方米。医院设有16个临床科室：牙体牙髓科、牙周科、口腔黏膜科、口腔颌面外科门诊、口腔颌面头颈肿瘤外科、口腔颌面整形创伤外科、麻醉科、口腔修复科、口腔正畸科、儿童口腔科、老年口腔病科、口腔急诊综合诊疗中心、口腔预防科、口腔特诊特需及MDT中心、口腔种植科、王府井部综合科；5个医技科室：药剂科、放射科、检验科、病理科、口腔修复工艺制作中心。全院共有产自德国、日本、芬兰等国家先进的牙科综合治疗台298台，病床编制100张，开放62张，可治疗各种口腔颌面疾病。2016年门急诊量76万余人次，日均门诊量3000余人次，年收治住院患者2200余人次。获得口腔类别四项“国家临床重点专科”建设项目：口腔颌面外科、口腔修复科、牙体牙髓科、口腔正畸科。北京市牙病防治所挂靠我院，承担着组织全市为适龄儿童免费窝沟封闭预防龋齿等项目。同时，我院是中华口腔医学会“中国唇腭裂诊治联盟核心成员单位”，是“微笑列车”项目承办单位。
医院现有员工1100余人，其中卫生技术人员1000余人，聘任高级专业技术职务170余人，中级200余人，拥有博士生导师15人，硕士生导师55人。医院作为我国高层次口腔医学专业人才的培养基地，拥有突出贡献专家3人，享受政府津贴专家9人，国家杰出青年科学基金2人，国家杰出青年科学基金B类（海外青年学者合作研究基金）资助1人，国家优秀青年科学奖励基金1人，教育部新世纪优秀人才1人，北京市海外人才聚集工程2人，北京市医院管理局“使命”计划1人、“登峰”计划1人，入选北京卫生系统高层次技术人才工程学科带头人2人、学科骨干15人，新世纪"百千万"人才工程计划北京市级人选2人，北京市优秀青年人才1人，北京市优秀人才专项26人、拔尖团队1项，北京市科技新星计划28人，北京市十百千卫生人才工程14人等一批高水平的优秀人才。
为了建设国内一流的现代化口腔医院，医院历届党政领导班子始终坚持“科教兴院”的方针，高度重视科研、教学工作，不断拓展科研领域，现已形成口腔医学临床研究与基础研究相互促进，综合性研究与专题研究紧密配合的良性循环，在口腔医学研究领域取得了丰硕的成果。医院承担多项国家级、省部级课题，获得国家科技进步二等奖2项，北京市科学技术奖一等奖1项，中华医学科技奖三等奖2项；获国际牙科领域重要的William J Gies奖（年度最佳研究论文奖）及JDR最佳封面论文两项大奖；1篇论文获全国百篇优秀博士论文。获授权发明专利9项，实用新型专利18项；主编、主译、参编专著60余部；在国内外专业杂志发表专业论文千余篇，其中SCI收录250余篇。
北京口腔医学研究所成立于1989年，设有基因治疗分子生物学、口腔微生物、口腔生物材料、组织细胞培养等多个实验室，与美国国立卫生研究院（NIH）、法国、英国、日本、芬兰等国家的大学和科研机构进行了多项合作课题的研究。2010年，研究所“全牙再生与口腔组织功能重建实验室”成为北京市重点实验室。我院同时也是国家药物临床试验机构。
我院多年来广泛与外省市进行口腔学科合作支援建设，并致力于开展口腔健康教育、社区健康促进等工作。目前与十余家单位签署了技术帮扶合作协议。每年派出各级别专家、医师赴支援单位进行会诊、授课，赴北京周边区县医院帮扶诊治患者。同时，近年来派出多位医师参与援疆、博士团服务、人才京郊行等服务工作。北京市牙病防治所挂靠在我院，作为牵头单位，我院指导北京市16个区县开展为适龄儿童免费窝沟封闭预防龋齿、免费氟化泡沫预防龋齿项目，累计百余万人次。并参与举办口腔健康咨询、义诊、讲座等公益活动。
北京口腔医学会挂靠在我院，同时，2005年成立北京市口腔医疗质量控制和改进中心，我院连任主任委员单位，为持续引导和促进北京地区的口腔医学事业发展起到了重要作用。