商丘市中医院肛肠科作为省级重点建设专科，院重点建设学科，是商丘市单一一个肛肠专业市级重点专科。科室技术力量雄厚，拥有多位肛肠疾病专业技术骨干。肛肠科主任丁建华是商丘市市级专业技术带头人、中华中医药学会肛肠专业理事会常务理事、商丘市肛肠学会副会长兼秘书长，曾荣获“全国中医肛肠学科名专家”、“河南省首届肛肠学科知名专家”、“商丘市五一劳动奖章”、“商丘市市级学术技术带头人”、“2011年度河南省科技领军人物”、“商丘市第六批专业技术拔尖人才”等荣誉称号；科室技术骨干理论扎实，业务娴熟，对于各种肛肠疾病的治疗有着丰富的临床经验。
肛肠科从人才培养到设备引进都走在行内前列。现已开设现代化独立病区，开展床位50余张，设有高级单人、双人及三人病房，拥有肛肠科独立的肠镜室、B超室、专业灌肠、熏洗等治疗室，先后引进了直肠腔内超声仪、韩国多尼尔电子肛肠检查成像系统、全自动结肠水疗透析仪、电子结肠镜、多功能药物熏洗治疗机、生物反馈治疗系统、肛门测压仪等国际前沿的肛肠诊疗设备，可开展X线排粪造影、结肠运输实验等检查。
肛肠科采用中西医结合特色疗法治疗各种痔、肛瘘、直肠脱垂、结直肠炎、结直肠肿瘤、直肠狭窄、便秘、会阴下降综合征等常见病、多发病以及疑难肛肠病，其中由科主任丁建华主持的“混合痔悬吊荷包切除术”荣获商丘市科技进步一等奖。科室尤其重视中医特色，住院患者全部按照国家中医药管理局制定的特色病症管理要求的中医临床路径和诊疗方案进行管理，使患者住院费用大幅度降低，并独自开发了多种行之有效的中药制剂广泛用于肛肠科临床治疗过程中，在临床中应用中药贴敷、中药熏洗、中药灌肠、针灸等多种中医治疗手段，取得了很好的疗效。科室在治疗中特别强调微创和无痛观念，使患者的治疗痛苦大为减轻，多年来，在肛肠病的治疗和预防中积累了丰富的临床经验，提升了肛肠疑难病的处理能力，为更多患者减轻痛苦。