广州市儿童医院1953年8月1日正式成立，前身为达·保罗医院。经过50多年的发展，我院已成为国内较有影响的儿童医院之一，是一所集预防、医疗、保健、康复于一体，临床、教学、科研并重的儿童专科三级甲等医院。
我院1994年建立广州市儿科研究所，1997年被评为广东省高等院校第一批入选教学基地，1998年定为广州医学院附属儿童医院。1996年我院新生儿专业被选为广东省"五个一"工程项目。广州市重症儿童救治中心于1998年成立，并被评为广州市"21世纪优先工程项目"，2003年被评为广州市重点学科、广东省特色专业。
我院门诊部设普通门诊和专科门诊，有小儿内科、外科、皮肤科、神经康复科、中医科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、保健科、理疗科等，以满足不同患者的需求。2005年我院门诊量134万余人次，急诊抢救成功率达98.34%。
我院住院部有400张床位，设感染、消化、呼吸、肾病、血液、神经康复、心血管、内分泌、新生儿内科、新生儿外科、泌尿外科、骨科、新生儿外科、烧伤、小儿普外、心胸外科、口腔外科、耳鼻咽喉科、眼科等病区。2005年出院病人2.1万余人次。
我院十分重视重点学科的建设，新生儿专业、神经康复专业、心血管专业、重症监护室、口腔专业、新生儿外科为重点专业。新生儿专业是广东省新生儿专业技术人员的培训中心，技术和设备在国内处于领先水平，2005年新生儿抢救成功率为93.23%;神经康复专业使用中西医结合的方法为患有神经、精神、心理、行为等障碍的儿童提供高水平的预防和保健、康复治疗服务;心血管专业在国内最早采用超声引导球囊房间隔造口技术姑息治疗新生儿危重先天心脏病，并开展小儿动脉导管未闭、肺动脉瓣狭窄、房间隔缺损等病的介入治疗，疗效显著，2005年开展心胸外科手术244台;广州市重症儿童救治中心由重症监护室(ICU)、新生儿重症监护室(NICU)和急诊科组成，创立的广东地区新生儿危重病救治网络为全国首创，配备现代化装备和先进的奔驰救护车3辆，出车达全省每一地区及周边省份，2005年转运病人出车行程约19.8万公里，共计881人次(未含MR检查出车);口腔专业在全国较早开展婴儿期腭裂手术，手术患儿最小年龄为2个月，2005年唇腭裂手术达416台。
医院的特色专业也得到长足的发展，消化专业的小儿胃镜、呼吸专业的纤维支气管镜、儿外科的腹腔镜使用技术日趋成熟。内分泌专业加强了内分泌实验室的建设;肾脏专业的血液透析，血液灌流、血液滤过、血液净化等治疗技术在抢救危重病人中发挥了一定作用;耳鼻喉专业的小儿耳鼻喉内窥镜检查、小儿听力检测和评估、小儿睡眠呼吸障碍综合症的诊断及治疗在华南地区乃至全国处于领先水平。眼科开展了社区儿童眼保健工作，推动了广州市儿童眼保健事业的发展。
为提高临床科研力量，中心实验室现已建设成为医院的科研平台，目前是华南地区医院仅有的能进行常规病毒分离的实验室，是世界卫生组织指定的流感监测中心之一，我院2005年被评为全国流感监测先进单位。2003年7月临床基因扩增实验室(PCR实验室)通过了国家卫生部临床检验中心的技术验收，根据实际需要建立了一系列的基因快速诊断技术项目。
通过广纳各地之长，我院整体专业技术和管理水平都有了显著的提高。医院一大批优秀专家特别是大批中青年专家曾出国进修、留学以及经国内高水平的医疗机构培训。医院与国内外多家儿童医院结为姐妹医院或友好医院，经常邀请国内外专家来我院作短期工作或学术交流、讲学、手术示范和疑难病例讨论，仅2005年我院就接待了外宾36人次。
我院多年来通过开展"以病人为中心"系列主题活动，树立了良好的医院形象。医院获广州市1997-1999年度最佳服务单位、2001年度全省卫生系统行业作风先进集体、广州市卫生局系统行风建设标兵单位、2003年广东省优秀基层党组织、广东省、广州市"抗击非典模范单位"等荣誉。
广州市妇女儿童医疗中心是由原广州市儿童医院、原广州市妇幼保健院(广州市妇婴医院)整合而成的集医疗、保健、预防、教学、科研于一体的副局级事业单位，加挂广州市儿童医院、广州市妇幼保健院和广州市妇婴医院牌子，隶属广州市卫生局管理。中心内设中心办公室等9个职能部门、内科部等9个业务部门和2个院区管理办公室。中心设置床位1357张，编制人数2533人。
2007年6月，中心领导班子正式成立，刘忠奇同志任中心党委书记，夏慧敏同志任中心主任，麦卫阳同志任中心党委副书记，冯琼、王洪涛、龚四堂、廖灿等四位同志任中心副主任。中心领导班子的确定，标志着广州市妇女儿童医疗中心的整合工作的开始。目前，中心除继续保持原广州市儿童医院、广州市妇幼保健院提供的各项服务外，还正在美丽的珠江新城建设一个崭新的院区，该院区占地2.4万平方米，将建成使用面积为8.6万平方米的医院建筑群，总建设投资达5.5亿元。
为适应广大妇女儿童的医疗保健需求，中心正对三个院区的功能布局和学科布局进行整合，发展复合型优势学科，加强人才队伍建设，合理配置先进设备，改善服务之软硬条件，营造良好的医院文化氛围。
中心将坚持以人为本、科学发展为第一要务，以“立足广州、面向华南、全国一流”为目标，竭诚为广大妇女儿童提供安全、高效、优质、温馨的医疗保健服务。
广州市儿童医院十分重视重点学科的建设，新生儿专业、神经康复专业、心血管专业、重症监护室、口腔专业、新生儿外科为重点专业。新生儿专业是广东省新生儿专业技术人员的培训中心，技术和设备在国内处于领先水平，2005年新生儿?救成功率为93.23%；神经康复专业使用中西医结合的方法为患有神经、精神、心理、行为等障碍的儿童提供高水平的预防和保健、康复治疗服务；心血管专业在国内最早采用超声引导球囊房间隔造口技术姑息治疗新生儿危重先天心脏病，并开展小儿动脉导管未闭、肺动脉瓣狭窄、房间隔缺损等病的介入治疗，疗效显著，2005年开展心胸外科手术244台；广州市重症儿童救治中心由重症监护室（ICU）、新生儿重症监护室（NICU）和急诊科组成，创立的广东地区新生儿危重病救治网络为全国首创，配备现代化装备和先进的奔驰救护车3辆，出车达全省每一地区及周边省份，2005年转运病人出车行程约19.8万公里，共计881人次(未含MR检查出车)；口腔专业在全国较早开展婴儿期腭裂手术，手术患儿最小年龄为2个月，2005年唇腭裂手术达416台。
广州市儿童医院的特色专业也得到长足的发展，消化专业的小儿胃镜、呼吸专业的纤维支气管镜、儿外科的腹腔镜使用技术日趋成熟。内分泌专业加强了内分泌实验室的建设；肾脏专业的血液透析，血液灌流、血液滤过、血液净化等治疗技术在抢救危重病人中发挥了一定作用；耳鼻喉专业的小儿耳鼻喉内窥镜检查、小儿听力检测和评估、小儿睡眠呼吸障碍综合症的诊断及治疗在华南地区乃至全国处于领先水平。眼科开展了社区儿童眼保健工作，推动了广州市儿童眼保健事业的发展。
医院获广州市1997-1999年度最佳服务单位、2001年度全省卫生系统行业作风先进集体、广州市卫生局系统行风建设标兵单位、2003年广东省优秀基层党组织、广东省、广州市"抗击非典模范单位"等荣誉。