济宁市中医院是全市单一的三级综合性中医院，该院聚集众多代表我市较高水平的各个专业的名中医，并培养了一大批以硕士研究生为主体的西医技术骨干，现已发展成为鲁西南中医、中西医结合医疗、教学、科研、保健中心。
为解决百姓看病难、看病贵问题，医院在努力提高医疗质量，搞好优质服务的同时，积极控制收费价格，在很多病种上实行了限价服务，受到了各级领导的好评。目前，我院已被省政府确定位为我市三级医院中单一的“山东省医疗救助定点医院”，并拟被市政府确定为济宁市惠民医院。同时，医院被拟定为“山东省中医药高等专科学校附属医院”，现正在迎接山东省教育厅、卫生厅的评估和验收。
医院现有在职职工 440 人，专业技术人员占 90% 以上，临床业务人员中研究生近 20 人，正副主 任 医师 50 余人，中级专业技术人员 170 人。设有内科、外科、骨伤科、妇产科、儿科、糖尿病科、肾病科、肿瘤科、脑血管病科、男科、急症科、五官科、针灸推拿科等 29 个临床医技科室，一个介入治疗中心，一个造血干细胞移植中心，一个超声刀治疗中心、一个腰椎间盘治疗中心、一个康复治疗中心、一个血液透析中心、一个健康查体中心。其中糖尿病科被省中医管理局批准为重点专科，肾病科、针灸推拿科为市重点专科。
医院装备了全市较先进的肿瘤超声聚焦刀，德国西门子大型C型臂数字减影系统、螺旋 CT ，德国wolf全套腹腔镜，法国AGFA数字成像系统（CR），全自动生化分析仪，意大利百胜彩超，多功能透析机（人工肝），日本产 NIPRO 血液透析机，数字胃肠机，新型电磁波碎石机等多台名优设备。
在业务建设方面，医院定位在“中医是龙头、西医逐潮流”，在发挥中医特长的同时，充分利用现代医学治疗急症的优势，坚持不懈地走出了一条中西医结合的路子。目前成功地开展了多项具有国内先进水平的新技术项目，如肾移植、造血干细胞移植治疗恶性淋巴瘤、糖尿病坏疽、脉管炎，腹腔镜下多种微创手术等。
医院重视人才培养，坚持科技兴院。近几年来先后派出数十名中青年骨干赴上海、天津等国内一流医院进修深造。近年来获奖科研成果 15 项，发明专利 7 项，省级以上刊物发表论文 200 余篇。医院还长期担负着山东中医药大学、山东省中医药高等专科学校、泰山医学院、济宁医学院、曲阜中医药学校、济宁卫校、枣庄第二卫校、淄博第二卫校的临床教学任务，每年接受实习学生近百名
近几年来，医院始终以“服务优质、技术精良、价格低廉”为服务宗旨，面对众多的普通城乡居民，竭力办成老百姓治得起病、治得好病的医院。