多数结直肠疾症是由粘膜腺体发育不良、息肉样腺瘤的形成发展而来，由于最终发展成恶性疾症需要几十年的时间，所以早期疾症的检测与筛查和内镜下腺瘤的切除是恶性疾症控制的重点。研究表明，肠道细菌代谢物如短链脂肪酸也与肠道健康有关。因此代谢组学结合宏基因组的分析可能通过肠道环境的变化来了解结直肠疾症的发展提供一种方法。
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