哈尔滨医科大学附属第一医院始建于1949年，经过60年的发展，由一所230张床位、395名职工的小型医院，发展成为集医疗、教学、科研为一体的大型综合性医院。
医院是黑龙江省最大的医疗中心，医疗专科设置齐全，技术力量雄厚。医院设有门诊部、住院处、急诊急救中心、远程会诊中心等业务机构，共有93个临床科室，54个医技科室，现有员工5111人，副高职称以上专业人员908人，拥有开放床位4,398张。2012年门、急诊量达198.8万人次，住院手术7.25万例。医院同时承担着副省级以上领导及重要外宾的保健、诊疗任务。
1992年被评为“三级甲等”医院;1998年获全国“百佳医院”称号，2010年再次以全省最高分通过三级甲等医院复审。医院与省内外90余家医院结成了协作医院，医疗辐射周边国家和地区。病理科、血液内科、心血管内科、心脏大血管外科、神经外科、神经精神科、中西医结合肿瘤科、普外科、神经内科、肾内科、眼科、临床护理部等12个专科被评为国家临床重点专科建设项目，血液内科、神经外科等23个专科成为黑龙江省医疗质量控制中心，拥有11个省重点学科，普外科被列为国家重点学科(培育学科)，心血管内科、神经外科和血液内科为冲击“十二五”国家重点学科。医院以技术创新为源动力，实施“专科有特色，专家有特长”发展战略，每年近百项先进技术应用于临床。
医院有临床医学、口腔医学专业，设28个教研室，7个教研组，承担五年制、七年制教学和留学生、进修生、成人教育的培养任务。临床医学为一级学科博士、硕士授予点，口腔临床医学为二级学科博士、硕士授予点，是国家优秀示范临床教学基地。2011年获得“全国首家五星级示范临床教学基地”称号。在院学生3，000余人，年接收进修医师近400人。
医院具有较强的科研实力，卫生部细胞移植、省普通高校肝脾外科和省普通高校神经外科重点实验室均设在医院。拥有1个省级、7个校级研究所，设40个研究室，医院设有临床医学和口腔临床医学博士后科研流动站。医院发明的亚砷酸注射液被评为国家二类新药，在中国科学院2000年《科学发展报告》中被称为20世纪中国十大科技发明之一;医院研制的双黄连制剂获省政府优秀成果奖。近几年，承担国家和省重大科研项目近百项，获国家、部省级科技成果奖数十项。
医院积极参加社会公益活动，成为多项慈善基金定点医院，每年定期组织专家医疗队赴贫困、边远地区义诊。60年来，多次组建医疗队应对突发事件，圆满完成任务，受到上级有关部门的表彰奖励。2008年“5.12”汶川地震发生后，医院先后派出71人次前往四川支援抗震救灾，被评为省卫生系统抗震救灾标兵单位。2010年6月下旬，大兴安岭发生森林火灾，医院立即选派医疗队支援扑火。8月，伊春发生空难事故，医院派出专家医疗队赶赴伊春，参加抢救伤员的工作，收治了14名重伤员，无一人死亡。2011年12月9日，香港游客在吉林省榆树市发生车祸，连夜紧急转入医院后，经多学科昼夜奋战，针对每个伤员的状况，进行个性化治疗，到12月18日，救治效果显著，所有香港伤员均平安返回香港，受到省政府表扬。
2012年5月，舍己救人的最美女教师张丽莉病势危重转入医院，经过113天的精心治疗，使张丽莉转危为安，痊愈出院，哈医大一院出色的救治工作，受到中央政治局委员、国务委员刘延东同志和黑龙江省委书记吉炳轩同志的高度评价。
医院大力开展国际间学术交流，与美国、日本、加拿大、澳大利亚、英国、法国、荷兰、意大利、俄罗斯、港澳台等30多个国家和地区进行友好合作，2012年，经过认真评估考察，成为英国爱丁堡皇家外科学院和香港外科医学院基础外科及普外住院医师培训中心。每年举办国际、国内大型学术会议数十次。