本部的前身系北京市中医专家门诊部，是全国成立较早的一所中医专家门诊部。崔月犁同志生前一直担任门诊部名誉主任。1990年10月，在门诊部成立三周年庆祝大会上，宋任穷同志为门诊部题词：“群贤毕至，壮老咸集”，张平化同志题词：“名医荟萃”。
门诊部汇集了京城十多家大医院的数十位主任医师级的知名专家、教授，设有中医内科、妇科、儿科、皮外科、肿瘤、男女不育、针灸、正骨按摩、耳鼻喉、口腔、镶牙及针灸美容等科室。应诊的专家都是医德高尚，医术超群，积几十年临床经验，形成了各自不同的医术风格，甚至绝技。一九八七年六月经北京市西城区卫生局批准开诊。二00三年初，经北京市工商局西城分局批准更名为“北京百万中医门诊部”。至今已接待全国各地和海外华侨、台港澳同胞以及外国友人疑难病患者近百万人次，受到广大群众的欢迎。老专家，老教授们以精湛高超的医术，热情周到的服务，卓有成效的质量，将为您解除病痛。
2007年11月经中国民间中医医药研究开发协会报请国家中医药管理局批准，给我部颁发了“全国个性民营中医医疗机构”的荣誉证书。张藻南院长2007年、2011年先后两次荣获“全国个性民营中医医疗机构负责人”的光荣称号。
门诊部的宗旨是：充分发挥传统中医药特色和名老中医技术优势，发扬救死扶伤、无私奉献精神；以病人为中心，敬业爱岗，全心全意为广大人民群众提供低廉优质的医疗服务，为社会主义现代化建设贡献力量。