始建于1990年，是我区单一的妇幼保健机构，也是深圳市第一家“二级甲等妇幼保健院”。其占地面积2332米2，建筑面积4900米2。现有医护人深圳市南山区妇幼保健院员154人，其中高级专业技术人员15人。设有妇女保健科、儿童保健科、妇科、产科、儿科、新生儿科、麻醉科、检验科及功能科等业务科室，备有彩色B超诊断议、全自动生化分析仪、医用Χ光机、母婴多参数监护仪及牙科综合治疗机等大型设备。我院注重科学的管理，大力开展新技术，以一流的服务为宗旨，以科教兴医为动力，狠抓内涵建设。认真贯彻落实《母婴保健法》，积极创建爱婴医院，促进母乳喂养，真正地将“母亲安全、儿童优先”落到实处。
目前，儿保科在开展儿童系统保健的基础上，开展了儿童口腔保健、眼保健、心理咨询、智商测定、微量元素检查及营养咨询等业务；妇保科在开展妇女系统保健的基础上，开展了女工保健、婚前保健、婚前教育、乳腺保健、更年期保健、膳食保健等业务。在医疗工作中除开展日常的妇科、产科、儿科、新生儿科及性病防治等业务工作外，开展了孕早期致畸检查，羊水染色体检查、遗传疾病筛查、无痛人流术、术后镇痛术、无痛分娩等高难诊疗工作及导乐式分娩、家庭化产房及温馨病房等优质服务工作，并收到了良好的效果。我们将以不断创新的精神使我院医疗保健工作走上一个新台阶，满足广大群众的要求。