重庆三峡中心医院始建于1929年。始初为万县市民医院，解放后，1951年更名为万县专区人民医院，1979年更名为万县地区人民医院，1993年更名为万县市中心人民医院，1998年定名为重庆三峡中心医院。历经87年的发展，现已成为集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，辐射渝、鄂、川、陕，承担着周边23个区县2300万人口的公共医疗救治任务，年门诊量268.99万人次，年出院病人9.71万人次，年手术台次3.73万，年收入20.72亿元。拥有“全国五一劳动奖状”、“全国文明单位”、“全国百佳医院”、“全国卫生系统先进集体”、“全国百姓放心百佳示范医院”等省级以上荣誉150余项。
医院占地面积400亩，建筑面积达50.07万平方米（含在建和规划建筑面积）。设有1个总院，8个各具特色的分院：平湖分院、百安分院、江南分院、御安分院、肿瘤分院、急救分院、口腔分院、国医苑；拥有国家级医学专业中心8个、国家863计划参与项目1个、国家中医药管理局“十二五”重点专科培育项目1个、国家卫计委脑防委脑卒中二级预防诊疗优化项目1个、市级重点学科2个、市级特色专科3个、市级临床重点专科建设项目7个、市级中医重点专科2个、市级科研机构和医学研究中心4个、区级重点学科和特色专科20个、区级科研机构4个、区级质量控制中心1个。
是国家全科医生临床培养基地；国家住院医师规范化培训基地协同单位；全国首个中国环境与健康产学研合作创新示范基地；成功获得国家药物临床试验机构资格；是第三军医大学、四川医科大学、川北医学院等9所医学院校的教学医院和实习基地；川北医学院三峡临床学院；川北医学院、四川医科大学硕士生培养点；重庆市博士后科研工作站；重庆市护士规范化培训基地；重庆医科大学医学超声工程研究所三峡临床研究基地；渝东北片区106所乡镇中心卫生院、县级医院联盟指导医院；万州区内乡镇中心卫生院统筹发展师带徒医院。
医院设有编制床位2661张，开放床位3150张。现有职工5567人（含在职职工3756人，社会化用工1192人，离退休职工669人），其中享受国务院政府特殊津贴的医学专家9人，正高89人、副高287人，博士、硕士361人。拥有3.0T核磁共振、128层螺旋CT等设备9107台件。
医院科研成果斐然，荣获国家科技进步奖二等奖1项、重庆市科技进步奖一等奖1项、三等奖1项、重大科技成果奖1项，国家专利技术19项。广泛开展心内直视手术、介入手术、微创手术、碘125粒子植入技术、生物细胞免疫技术、海扶临床应用技术等，在国内达到先进水平。
充分认识到文化是医院的根和魂，是医院发展的内动力，在全国率先提出“文化融入治病，文化促进健康，文化促进医患和谐，文化促进可持续发展”的理念，积极探索医院环境、文化、医疗、保健协调发展的办院新路径，把医院建成百姓就医的大院、花园、公园、乐园及文化教育基地，打造出了全国独具特色的文化精品医院。