阿拉善中心医院是阿拉善盟盟府巴彦浩特地区单一集医疗、科研、教学、急救、制剂和预防保健为一体的综合性医院。多年来，该院争创一流的技术，一流的服务，一流的医德，一流的信誉，有力地促进了医院医疗事业的发展。年门诊量达10万多人次，住院病人4000多人次，手术量1000多台次，收入1000多万元，成为阿盟地区医疗行业的排头兵。
阿拉善中心医院不断培育人才，提高业务人员的整体水平，现有职工330人，其中卫生技术人员280人、副高以上职称25人、中级职称142人。为了不断提高业务人员的素质，他们每年派出20多人到外地进修学习；引进先进设备，为更好地开展医疗奠定了基础。目前医院已拥有全身CT扫描仪，500mAX光机，彩色多谱勒诊断仪，经颅多普勒诊断仪，EUB-40B超，脑电图机，半自动生化分析仪，全自动血球计数仪，全自动酶标仪，麻醉机，生命体征监护仪，心电监护仪，高频电刀，纤维胃镜，结肠镜，膀胱镜，裂隙灯等高精尖医疗设备，并兴建了干部保健病房和急救中心ICU病房。
随着医疗技术的不断提高和医疗设备的不断更新，阿拉善中心医院医护质量大幅度提高。诊断准确率、治愈好转率、危重病人抢救成功率均达到了95%以上。目前神经内科可借助CT扫描仪对各种急性脑血管意外病人进行救治；消化内科可采用国际先进的内窥镜技术，对消化道疾病进行诊断和治疗；外科可开展脊柱、椎间盘、颅脑、泌尿，小切口胆囊切除等大中手术；妇产科可开展宫颈癌清扫，腹式子宫切除加阴道前后壁修补等手术和运用先进的医疗技术进行药物流产。特别是开展的“自体角膜缘部上皮移植治疗翼胬肉”科研项目，填补了自治区对该项手术的空白，达到了全国的先进水平。
同时，阿拉善中心医院坚持“诊断及时准确，治疗安全有效、护理体贴周到”的服务宗旨，推行了“无假日医院”制和“承诺服务”；实行了微机网络化管理，开设了患者住院费自动查询系统，增加了收费的透明度；开展了“病人选择医生”改革，调动了广大医务人员的积极性；采取了药品集中招标采购办法，降低了药价，减轻了患者就医的负担。
特别是在2003年的防治“非典”工作中，阿拉善中心医院被指定为当地单一一家SARS专治医院。全院上下协同作战，不仅有效地治愈了一例“非典”疑似病人，而且实现了医务人员零感染。医院党支部被评为全区防治“非典”工作先进基层党组织，护理部副主任吴雪芳等9名医务人员分别被评为全区防治“非典”个性共产党员，全区防治“非典”先进个人和全区卫生系统防治“非典”先进个人。