兰州军区乌鲁木齐总医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的现代化大型综合性三级甲等医院，医院年平均门诊病人为46万人次，收治病人23000人次。是新疆维吾尔自治区、新疆生产建设兵团及乌鲁木齐市医疗保障制度改革定点医疗单位之一。
医院内设全军骨科中心、全军临床检验中心、全军计划生育优生优育指导中心、全军医药卫生二级科技查新站，以及兰州、新疆两级军区和新疆维吾尔自治区的一大批重点专科中心、研究所，是第四军医大学，新疆医科大学、石河子大学医学院的教学医院和硕士生培训点。医院现拥有双源CT、3.0核磁、ECT、准分子激光仪、细胞刀、直线加速器、X—刀、后装机、电镜、数字减影X机等价值约3亿元的高精尖医疗设备。通过采取多种途径，医院引进和培养硕士、博士生167人，在读硕博士人员29人，现有专家教授180多人，形成了一支以老专家、科室主任为核心、以中青年专业技术人员为骨干的医疗专业技术人才队伍。50余人被第四军医大学、新疆医科大学和石河子医学院聘为硕士生导师、兼职正副教授和讲师，40余名专家还兼任全国、全军各专业委员会的学术职务及各种杂志的编委。
2003年以来，医院获国家省部级以科技进步奖287项，开展新业务、新技术200余项。由我院临床医学研究所开展的“丝绸之路地区多民族血红蛋白病研究获国家科技进步二等奖，填补了兰州战区和新疆维吾尔自治区此奖项的空白。骨科中心开展的股骨大转子股骨头互换术、辅助人工髋关节治疗中青年股骨头坏死填补国际空白并获自治区科技进步一等奖。现开展的腹腔镜胆囊摘除术、镜下脑室网膜分流术、肝囊肿开窗术、筋膜骨瓣修复缺损、股骨大转子股骨头互换治疗中青年股骨头坏死、心脏不停跳冠脉搭桥术、癫痫外科及复杂颅脑外伤救治、PTCA支架置入术、ERCP支架置入术、网蓝取石术、自体外周血造血干细胞骨髓移植术、气管支气管支架置入术、成批烧伤的救治等新业务新技术，在新疆和西北地区乃至全国处于领先地位。医德医风建设取得明显成效，在国家统计局新疆城市社会经济调查大队和自治区消费者协会组织的“医生服务态度满意率”调查活动中，连续多年被评为第一，跃居自治区首府10大家医院之首。
新近投入使用的医技外科楼建筑面积4.3万平方米，地上19层，地下一层。全楼层采用瑞典得佳PVC地板，具有防尘、防电、抗菌、耐磨的优点。手术室空气净化选用国际先进的高效过滤器，大楼核心设备及部件均实现自动化控制。西北地区首家引进目前世界上最先进的西门子双源CT，突破了CT的单球管/单探测器系统的设计，使用两套球管探测器系统，可提供卓越的临床图像和世界最高的83ms的时间分辨率，所有检查时间均大大缩短。独有的双能量成像功能对疾病定性诊断开拓了新方法和理念，而且辐射剂量仅为现有CT的50%。