吉林市中西医结合肛肠医院始建于一九五六年，几十年来在省市有关部门的领导和支持下，经过老一代肛肠病专家郭振东、李允哲及全院几代人的共同努力，现已由建院初期的单纯痔瘘专科医院发展成为大肠外科、大肠内科、肛门外科即下消化道内、外科剂全的肛肠医院。为了更好的配合医院临床和科研教学工作，医院又增进了制剂室、医学情报室、临床科研实验室等十几个科室。
吉林市中西医结合肛肠医院移址另建后已进入了新的发展阶段，全院职工正以饱满的热情，良好的精神状态，将医院环境、医疗设备、医疗技术水平及科研能力向着全国一流专科医院的目标迈进。
吉林市中西医结合肛肠医院位于美丽的松花江畔，占地面积6000m2，建筑面积10563m2,设有床位250张，住院条件舒适，医院环境秀美，拥有国内外大中型诊疗设备70余件，其中日本产电子结肠镜、意大利产超声环振直肠探头先进的设备可为肠道疾病提供可行的诊断依据。
在专科建设和发展上，我院一直处于国内前列。医院自行研制的“消炎栓”、“生肌散”外洗冲制、玉红沙条及多种术后中药饮剂等专科用药效果好，深受广大患者的欢迎和青睐。近五十年来，我们坚持用中西医结合的方法，为国内外五十多万名患有内痔、外痔、混合痔、肛裂、肛瘘、肛周脓肿、大肠息肉、直肠粘膜脱垂、便秘、肛门闭锁、肛门狭窄、直肠阴道瘘、直肠癌、结肠癌、直肠炎、结肠炎的患者解除了病痛。
特别是，医院研究实施的治疗肛肠疾病的“全程无痛疗法”确保了肛肠病患者从治疗开始的全部过程在无疼痛的状态下进行，确实解决了肛肠病患者“疼痛”这一技术难题。这一疗法在国内处于仿造水平。八十年代以来，有多位全国著名肛肠专家如史兆岐、任学道、丁义江等来我院考查调研，对我院在肛肠病防治事业上取得的成绩和作出的贡献给予了充分的肯定。
吉林市中西医结合肛肠医院坚持以病人为中心，全心全意为患者服务的宗旨，坚持病人第一，质量第一的方针。以住院平均床日收费全市较低及医务人员精湛的医术、优质的服务，博得了广大省内外患者和国际友人的赞誉。医院连年被评为吉林市卫生系统的标兵单位、市精神文明建设先进单位。
一九九九年、二OOO年被国家质量管理协会评为质量管理先进单位，该院自九十年代以来先后被吉林市卫生局确定为重点专科医院，省中药管理局命名为吉林省中西医结合肛肠病医疗中心，国家中医药管理局确定为国家中西结合重点专病建设单位。