北京京坛医院临床和医技科室设置齐全，临床诊疗科室设有：泌尿男科、妇科两大专业科室。其中男科开设以下6大特色专业（前列腺疾病、前列腺康复保健、泌尿生殖感染疾病、性功能障碍疾病、男性生殖整形、男性不育），妇科开设以下6大专业（妇科炎症、宫颈疾病、妇科肿瘤、女性不孕、无痛人流、生殖整形），同时设有预防保健科、内科、外科、肛肠科、口腔科、医学急诊科、康复医学科、麻醉科及医学检验科、放射科、超声心电科等医技科室。床位可达150张。
北京京坛医院重视高、精、尖的现代化医疗设备的投入，配置的主要设备如500毫安X光机、C型臂X光机、胃镜、彩色超声波、黑白超声波、全自动生化分析仪、生自动血型分析仪、宫腔镜、数码电子阴道镜、16导联心电图仪，同时我们还有诸多治疗设备，如氩氦刀、艾克刀、凝固刀、利普刀、高频电刀、微波刀、超声聚焦刀、激光机、椎间盘激光治疗系统、离子刀、多级射频肿瘤消融治疗系统及电化学肿瘤治疗仪等。目前，正在积极引进如CT、乳腺钼钯机和腹腔镜等大型设备。同时，为抢救重症病人还设有ICU病房，得以全面配合专家资源优势以达到个性化诊断和有效治疗。
北京京坛医院住院部设置档次较高，护理条件优越，病房设有整套的中心供氧负压系统，独立卫生间，闭路电视，程控电话等现代化设施，并设立ICU病房，为住院患者提供温馨、舒适、方便、配套的治疗环境和一对一的服务，同时根据患者及亲属的需要提供全程亲情化的陪诊服务。
北京京坛医院注重人才引进，以“科技兴院、人才兴院、专家办院”和聚集一流人才，创一流特色品牌，提供一流优质服务为发展目标。在很短的时间内聚集了十数名国内医学界知名专家、教授，汇集了一批京城杏坛中西医结合德高望重、医术精湛的人才队伍。各临床和医技科室都配有学科带头人，为医院的临床诊断和治疗提供了可靠的医疗技术质量保障。
北京京坛医院从起步阶段就坚持高标准、高起点、严要求、规范化、以“尊重、理解、关爱、服务”为办院理念，遵循一切以病人为中心，一切以医疗质量为核心，一切以优质服务为重心，恪守医德第一、患者第一、服务第一、疗效第一、质量第一的办院宗旨，坚持执业行为法制化、管理方式制度化、基础质量规范化。竭诚为周边社区居民、流动人口及社会各界提供方便快捷、优质低廉、高标准、高质量、人性化的医疗技术服务，使首都南城地区百姓看病难、看病贵、找知名专家难的问题得到根本改变。