一座规模适宜、布局合理、功能齐全、建筑规范的传染病医院——自治区传染病医院，似一颗高原明珠，落成在拉萨市金珠西路。它的建成，填补了西藏无传染病专科医院的空白。
自治区传染病医院由上海市援建，上海市卫生局承建。这个医院按高于二级甲等专科医院水平设计，下设10个临床业务科室和6个职能科室。总建筑面积1.3万平方米，其中工作用房9500平方米(含住院部、门诊及放射、检验、药剂等科室)，床位规模400张，生活用房3068平方米。工程原计划投资2410万元，实际完成投资3820万元。工程于1995年5月开工，1996年6月28日竣工，工程质量为优良。当年8月8日举行移交典礼之后，上海市再投入220万元，增建一幢急诊部和两幢职工住宅，共计2820平方米。
西藏传染病医院在建筑风格上，既发扬了医疗用房的科学合理性，又从外观环境上力求尽善尽美。突出藏式建筑特色的医院大门庄重醒目，洁白的墙体托起棕褐色的琉璃瓦屋檐，门诊大厅宽敞洁净；院内环境优雅，松柏翠绿，草坪上鲜花争艳，供病人散步休息的凉亭典雅别致……这座花园式的医院，成为病人疗养康复的理想场所。
西藏曾经是传染病多发地区。和平解放后，人民政府关心西藏人民的健康，重视卫生防疫工作，建立了卫生防疫网络，加强了疫情的监督和管理，给儿童进行计划免疫，避免了重大疫情的发生。但是，传染病仍然是威胁西藏各族人民健康和生命的隐患。自治区传染病医院的建成，结束了西藏无传染病专科医院的历史，对西藏早日控制传染病将起到重要的促进作用。医院可承担拉萨市传染病人的收治任务和各地市的转诊病人，对地市医院的传染科进行业务指导，还可作为自治区卫校实习基地，并配合自治区卫生防疫站共同开展传染病防治工作。医院服务覆盖面积16平方公里，约10万人可直接接受各种医疗检查和有效治疗。
自西藏传染病医院落成以来，院方先后接待了北京中日友好医院、上海医科大学和世界卫生组织、国家卫生部以及从美国、日本等国来的各类团体近2000人来院参观考察，就连远道而来的寺庙中的僧尼，也对医院巧夺天工的建筑叹赏不已。对口支援的北京医院、中日友好医院、上海医科大学对援藏工作非常重视，从技术、仪器设备、人才培养、科研等方面大力支持，使该医院的综合功能日趋完善，医疗水平、管理水平迅速提高，取得了良好的社会效益和经济效益。三年来，医院派出进修学习人员60余人次，学习引进技术，新增了20多个医疗项目，大大提高了医疗效果，各项指标与新医院建成前相比都有了明显提高。
目前，自治区传染病医院已成为综合性第二人民医院，正向一流医院、一流管理、一流服务方向努力